您使用了错误的选择器，或者需要在div上设置ID而不是类：

<div id="message">MESSAGE</div>

否则你需要

document.querySelector(".message")

注意点
还要确保在元素存在之后执行代码。
我认为这是一个X/Y问题，因为localstorage.length永远不会是0，因为它有其他你没有放进去的东西。
我会的

window.addEventListener("DOMContentLoaded", () => {
  let myImageArray = localStorage.getItem("myImages") || [];
  const message = document.getElementById('message');
  const toggleMessage = () => message.hidden = myImageArray.length > 0;
  const updateLocalStorage() => {
    localStorage.setItem("myImages", myImagesArray); // only one place is updating localStorage
    toggleMessage();
  }
  const addImage = imageId => {
    myImagesArray.push(imageId);
    updateLocalStorage();
  };
  const removeImage = imageId => {
    myImagesArray = myImagesArray.filter(img => img !== imageId)
    updateLocalStorage();
  };
  toggleMessage(); // initialise
});

并且具有

<div id="message" hidden>MESSAGE</div>

我认为您只需将class更改为id：

<div id="message">MESSAGE</div>

和JS：

document.getElementById('message').style.display = localStorage.length === 0 ? '' : 'none';