就我个人而言，我对Eclipse JDT没有什么好的经验，在遇到断点时添加源文件夹。我总是更喜欢在调试之前添加源文件夹：
1.选择项目/属性/库
1.选择您的库并“编辑...”source attachment
1.选择相应的源文件夹或包含包的zip/jar文件夹
之后，您应该能够打开虚拟“Referenced Libraries”文件夹中的源文件（直接位于项目中的“JRE System Library”文件夹下），或者在JDT编辑器中打开对链接类文件的引用时打开。如果您能够访问源文件，那么您至少也应该能够在断点处停止并查看相应的源文件。
否则，您必须再次检查源文件夹是否确实有效：源文件夹或源归档文件必须包含库的根包名称的文件夹（例如JDK文件夹中默认的Java“src.zip“在其根目录下也包含相应的“java”文件夹）。如果有疑问，请解压缩归档文件并选择您感兴趣的包的父文件夹-有时源归档文件可能很乱或与JDT不兼容。
如果这一点已经得到保证，但仍然不起作用，那么很可能是您链接的源文件夹与库的编译版本不对应。通常JDT可以很好地处理这种不一致，但是如果您试图打开一个与相应的类文件完全不同的源文件，您将遇到问题。在这种情况下，我建议您下载库的正确源版本，或者从源代码重新编译库（如果所有其他操作都失败）。
如果在JDT编辑器中打开引用的源文件可以正常工作，并且在调试期间输入断点时仍然无法打开源文件，则很可能是类文件是对应源文件的missing the line numbers。同样，在这种情况下，您必须从源文件重新编译库。
最后，也可以通过在启动配置的source选项卡中指定源文件夹或存档来覆盖默认的源代码查找，但如果构建路径配置正确，通常不需要这样做。
“源”选项卡定义调试Java应用程序时用于显示源的源文件的位置。默认情况下，这些设置派生自关联项目的生成路径。您可以在此处覆盖这些设置。

这个问题困扰了我很长一段时间，但我最终解决了它。在我的例子中，Java的Transformer. IsRuntimeCode（ProtectionDomain）函数中的某个地方抛出了一个空指针异常。
我其实并不需要知道这些，因为异常已经被捕获和处理了，但是eclipse会在每次发生这种情况时暂停调试，并告诉我源代码不可用，结果，我不得不不断地按下按钮继续代码执行。
为了防止这种情况发生，我：

1. Clicked on the "Breakpoints" window at the bottom of the debugging
    screen
 2. Right clicked "NullPointerException"
 3. Unchecked "Caught"

这可防止调试器在捕获NullPointerException.alt文本期间暂停程序流

（来源：SharpDetail.com）
这是另一个：
Eclipse不会崩溃。您正在尝试单步执行一个方法，而eclipse不知道在哪里可以找到源（*. java）文件，并通知您这一点。下面是如何告诉eclipse在哪里查找。请转到

Window->Preferences->Java->Installed JREs,select the JRE you are using and click Edit.

在那里，选择您看到的列表中的所有jar文件，然后单击Source Attachment ...。
在显示的窗口中，选择文件www.example.com，它位于JDK文件夹中（如果在安装JDK时没有取消选中它）。src.zip, which is in your JDK folder (if you didn't uncheck it while installing the JDK). On the machine I'm on right now, that is

C:\Program Files\Java\jdk1.7.0_07\src.zip.

保存你所有的修改（可能重启eclipse），你就不会再看到那个错误了。

结果发现这个解决方案是虎头蛇尾的。当Balder的建议不起作用时，我试着调试一个OpenFire的插件，它工作得很好。然后我从头开始创建了一个新的插件。并且除了将源代码添加到项目之外不执行任何操作（右键单击项目-〉新建-〉源文件夹）它也工作得很好。我不知道为什么Eclipse拒绝看到我的原始插件的源文件，但是我把我所有的代码和库都移到了新的插件上，调试工作正如预期的那样。

很多时候，当下载应用程序的二进制版本时，您将jar文件作为引用库放入Eclipse IDE中。通常通过配置构建路径来完成。但是二进制文件没有源文件。您有应用程序的二进制版本和源版本。
一个简单的方法是下载源代码库，你也可以使用maven来构建项目。保留一些，可能在你的项目工作区中。
现在，当看到类文件（从eclipse，jar爆炸），你可能会看到源代码没有找到，罚款....有一个按钮下面，点击它，一个新的窗口打开，并在那里选择添加外部文件夹。
将它引用到您下载的源代码（不是二进制代码）的src文件夹，并如上所述保存在某个地方，它将显示来自该文件夹的类细节。

我通过执行以下操作修复了此问题：
点击菜单窗口-首选项-调试-步骤过滤并检查所有的软件包，如下图所示。
(Step Filtering)
然后，再次调试您的项目，就这样了。
此致，

在我的例子中，我在类声明中有一个断点，我的意思是在下一行。
public class GenerateInterface implements JavaCall {
因此，调试器在该行停止并显示以下消息：
未找到资源
我想是无意识地激活了那一行的断点。

在我的例子中，我在使用TestNG和Selenium Java进行调试时发现未找到源代码。使用@Test方法的测试用例未能找到元素，但无法找到要抛出的异常，并在TextInvoker. invokeMethod处告诉我“未找到源代码”。
我通过将TestNG从6.14.3降级到6.11进行了修复。然后，我添加了另外两个依赖于Maven的库和TestNG。enter image description here
然后重启Eclipse再次调试，这次调试停在某个TestNG方法上，一直按F7直到调试结束，然后查看TestNG报告，发现错误（元素不可交互）。
希望这能对你的情况有所帮助！