虽然使用原始SQL查询可能比使用存储库更快，但不建议在Magento 2中直接使用它们。Magento 2严重依赖其ORM（对象关系Map）系统，并使用它来管理数据库操作。
在您的情况下，如果使用存储库导入类别数据花费了太多时间，您可以尝试优化导入过程。在Magento 2中优化导入过程的一些技巧包括：

批处理-不是一次插入所有类别数据，而是分批插入数据以减少数据库的负载。
禁用不必要的索引-您可以在导入数据时临时禁用某些索引，并在导入完成后再次启用它们。
优化您的代码-确保您的代码针对性能进行了优化。例如，避免加载不必要的数据或执行不必要的查询。
使用第三方扩展-您可以使用第三方扩展来优化导入过程。Magento市场中有许多扩展可以帮助您更快地导入数据。

总的来说，不建议直接在Magento 2中使用原始SQL查询。