要使用IN，必须有一个集合，请改用以下语法：

SELECT * FROM Table1 WHERE Table1.principal NOT IN (SELECT principal FROM table2)

子查询选项已经回答过了，但请注意，在许多情况下，LEFT JOIN可能是完成此操作的更快方法：

SELECT table1.*
FROM table1 LEFT JOIN table2 ON table2.principal=table1.principal
WHERE table2.principal IS NULL

如果你想检查多个表，以确保它不存在于任何一个表中（如SRKR的注解），你可以使用以下代码：

SELECT table1.*
FROM table1
LEFT JOIN table2 ON table2.name=table1.name
LEFT JOIN table3 ON table3.name=table1.name
WHERE table2.name IS NULL AND table3.name IS NULL

MySQL以及除SQL Server之外的所有其他系统都能够优化**LEFT JOIN/IS NULL，以便在找到匹配值时立即返回FALSE，并且它是唯一关心记录此行为的系统。[...]由于MySQL无法使用HASH和MERGE连接算法，ANTI JOIN的唯一功能是NESTED LOOPS ANTI JOIN
[...]
从本质上讲，[NOT IN] 与LEFT JOIN/IS NULL使用的计划完全相同，尽管这些计划由不同的代码分支执行，并且在EXPLAIN的结果中看起来不同。实际上，算法是相同的，查询在同一时间完成。
[...]
很难说 [使用**NOT EXISTS**时性能下降] 的确切原因，因为这种下降是线性的，似乎不依赖于数据分布、两个表中的值的数量等，只要两个字段都被索引。由于MySQL中有三段代码基本上完成一项工作，负责X1 M12 N1 X的代码可能进行某种额外的检查，这会花费额外的时间。
[...]
MySQL可以优化所有三个方法来做一种NESTED LOOPS ANTI JOIN。[...]然而，这三个方法生成三个不同的计划，由三段不同的代码执行。执行EXISTS predicate 的代码效率要低大约30% [...]
这就是为什么在MySQL中搜索缺失值的最佳方法是使用LEFT JOIN/IS NULL或NOT IN，而不是NOT EXISTS。**
（着重号后加）

小心NOT IN不是<> ANY的别名，而是<> ALL的别名！
http://dev.mysql.com/doc/refman/5.0/en/any-in-some-subqueries.html

SELECT c FROM t1 LEFT JOIN t2 USING (c) WHERE t2.c IS NULL

不能被取代

SELECT c FROM t1 WHERE c NOT IN (SELECT c FROM t2)

您必须使用

SELECT c FROM t1 WHERE c <> ANY (SELECT c FROM t2)

不幸的是，这似乎是MySql使用“NOT IN”子句的问题，下面的屏幕截图显示了返回错误结果的子查询选项：

mysql> show variables like '%version%';
+-------------------------+------------------------------+
| Variable_name           | Value                        |
+-------------------------+------------------------------+
| innodb_version          | 1.1.8                        |
| protocol_version        | 10                           |
| slave_type_conversions  |                              |
| version                 | 5.5.21                       |
| version_comment         | MySQL Community Server (GPL) |
| version_compile_machine | x86_64                       |
| version_compile_os      | Linux                        |
+-------------------------+------------------------------+
7 rows in set (0.07 sec)

mysql> select count(*) from TABLE_A where TABLE_A.Pkey not in (select distinct TABLE_B.Fkey from TABLE_B );
+----------+
| count(*) |
+----------+
|        0 |
+----------+
1 row in set (0.07 sec)

mysql> select count(*) from TABLE_A left join TABLE_B on TABLE_A.Pkey = TABLE_B.Fkey where TABLE_B.Pkey is null;
+----------+
| count(*) |
+----------+
|      139 |
+----------+
1 row in set (0.06 sec)

mysql> select count(*) from TABLE_A where NOT EXISTS (select * FROM TABLE_B WHERE TABLE_B.Fkey = TABLE_A.Pkey );
+----------+
| count(*) |
+----------+
|      139 |
+----------+
1 row in set (0.06 sec)

mysql>

以上答案都是正确的，但是很难理解，为了更清楚，我举个例子来回答，假设你要选择所有不在优秀表中的人：
备选案文1：

select *
 from persons p
 where not exists(select * 
                 from outstandings o
                 where p.id = o.id)

备选案文2：

select *
    from persons p
    where p.id not in( select m.id
                      from outstandings o
                      where m.id = o.id)

备选案文3：

select *
    from persons p
    left join utstandings o on o.id=p.id
    where o.id in null