MongoDB是ACID compliant，所以它应该负责决定返回什么文档，即使有一个插入正在进行中。如果你确实认为你的查询没有返回你想要插入的文档，那么你需要在Go端解决这个问题。
使用通道来管理你的控制流。沿着以下方式：

select {
case query := <-queryChan:
  // do mongo query, make sure to include a return channel in the query struct so you can collect your results
  query.results <- // the results
case insert := <-insertChan
  // do mongo insert
}

将其 Package 在单个goroutine中，以确保数据库操作按顺序进行。