最后，我得到了一个解决我的查询...
将下面的代码放在Activity的onCreate()方法中。
Kotlin代码

val navHostFragment = (supportFragmentManager.findFragmentById(R.id.home_nav_fragment) as NavHostFragment)
val inflater = navHostFragment.navController.navInflater
val graph = inflater.inflate(R.navigation.nav_main)
//graph.addArgument("argument", NavArgument)
graph.setStartDestination(R.id.fragment1)
//or
//graph.setStartDestination(R.id.fragment2)

navHostFragment.navController.graph = graph

Java代码

NavHostFragment navHostFragment = (NavHostFragment) getSupportFragmentManager().findFragmentById(R.id.home_nav_fragment);  // Hostfragment
NavInflater inflater = navHostFragment.getNavController().getNavInflater();
NavGraph graph = inflater.inflate(R.navigation.nav_main);
//graph.addArgument("argument", NavArgument)
graph.setStartDestination(R.id.fragment1);

navHostFragment.getNavController().setGraph(graph);
navHostFragment.getNavController().getGraph().setDefaultArguments(getIntent().getExtras());

NavigationView navigationView = findViewById(R.id.navigationView);
NavigationUI.setupWithNavController(navigationView, navHostFragment.getNavController());

附加信息

按照@artnest的建议，从布局中删除app:navGraph属性。

<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
<FrameLayout xmlns:android="http://schemas.android.com/apk/res/android"
    xmlns:app="http://schemas.android.com/apk/res-auto"
    xmlns:tools="http://schemas.android.com/tools"
    android:layout_width="match_parent"
    android:layout_height="match_parent">

    <androidx.fragment.app.FragmentContainerView
        android:id="@+id/home_nav_fragment"
        android:name="androidx.navigation.fragment.NavHostFragment"
        android:layout_width="match_parent"
        android:layout_height="match_parent"
        app:defaultNavHost="true" />

</FrameLayout>

在使用fragment标记代替FragmentContainerView的情况下，上述更改保持不变

一些API已经改变，不可用或自Akash's answer以来不需要。现在更简单了。
MainActivity.java：

@Override
protected void onCreate(Bundle savedInstanceState) {
  super.onCreate(savedInstanceState);
  setContentView(R.layout.activity_main);

  NavHostFragment navHost = (NavHostFragment) getSupportFragmentManager().findFragmentById(R.id.fragment_main_nav_host);
  NavController navController = navHost.getNavController();

  NavInflater navInflater = navController.getNavInflater();
  NavGraph graph = navInflater.inflate(R.navigation.navigation_main);

  if (false) {
    graph.setStartDestination(R.id.oneFragment);
  } else {
    graph.setStartDestination(R.id.twoFragment);
  }

  navController.setGraph(graph);
}

activity_main.xml：

<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
<androidx.constraintlayout.widget.ConstraintLayout 
  xmlns:android="http://schemas.android.com/apk/res/android"
  xmlns:app="http://schemas.android.com/apk/res-auto"
  xmlns:tools="http://schemas.android.com/tools"
  android:layout_width="match_parent"
  android:layout_height="match_parent"
  tools:context=".MainActivity">

  <!-- Following line omitted inside <fragment> -->
  <!-- app:navGraph="@navigation/navigation_main" -->
  <fragment
    android:id="@+id/fragment_main_nav_host"
    android:layout_width="match_parent"
    android:layout_height="match_parent"
    android:name="androidx.navigation.fragment.NavHostFragment"
  />

</androidx.constraintlayout.widget.ConstraintLayout>

navigation_main.xml：

<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
<!-- Following line omitted inside <navigation>-->
<!-- app:startDestination="@id/oneFragment" -->
<navigation xmlns:android="http://schemas.android.com/apk/res/android"
  xmlns:app="http://schemas.android.com/apk/res-auto"
  xmlns:tools="http://schemas.android.com/tools"
  android:id="@+id/navigation_main"
  >

  <fragment
    android:id="@+id/oneFragment"
    android:name="com.apponymous.apponymous.OneFragment"
    android:label="fragment_one"
    tools:layout="@layout/fragment_one"/>
  <fragment
    android:id="@+id/twoFragment"
    android:name="com.apponymous.apponymous.TwoFragment"
    android:label="fragment_two"
    tools:layout="@layout/fragment_two"/>
</navigation>

这可以通过navigation action来完成。因为fragmentA是你的起始目的地，所以在fragmentA中定义一个action。
请注意这两个字段：app:popUpToInclusive="true" app:popUpTo="@id/fragmentA"

<navigation xmlns:android="http://schemas.android.com/apk/res/android"
   xmlns:app="http://schemas.android.com/apk/res-auto"
   xmlns:tools="http://schemas.android.com/tools"
   android:id="@+id/lrf_navigation"
   app:startDestination="@id/fragmentA">

   <fragment
       android:id="@+id/fragmentA"
       android:name="com.mindinventory.FragmentA"
       android:label="fragment_a"
       tools:layout="@layout/fragment_a">

    <action android:id="@+id/action_a_to_b"
            app:destination="@id/fragmentB"
            app:popUpToInclusive="true"
            app:popUpTo="@id/fragmentA"/>
   <fragment>

   <fragment
       android:id="@+id/fragmentB"
       android:name="com.mindinventory.FragmentB"
       android:label="fragment_b"
       tools:layout="@layout/fragment_b"/>
</navigation>

当你的MainActivity启动时，只需要使用action id进行导航，它就会删除堆栈中的fragmentA，并跳转到fragmentB。看起来，fragmentB就是你的启动目的地。

if(!isAllSetUp)
{
  // FragmentB
  navController.navigate(R.id.action_a_to_b)
}

这不是一个答案，只是一个复制的@ akka 什帕特尔回答更干净和清晰的方式

// in your MainActivity
navController = findNavController(R.id.nav_host_fragment)
val graph = navController.navInflater.inflate(R.navigation.nav_graph)
if (Authentication.checkUserLoggedIn()) {
      graph.startDestination = R.id.homeFragment
} else {
      graph.startDestination = R.id.loginFragment
}
navController.graph = graph

你可以通过编程的方式设置你的启动目的地，但是，大多数时候你的启动逻辑会参考一些远程端点。如果你不在屏幕上显示任何东西，你的UI看起来会很糟糕。
我所做的总是显示一个启动屏幕。它将确定哪个是下一个要显示的屏幕。

例如，在上图中，您可以在启动屏幕状态下询问是否有保存的LoginToken。如果它为空，则导航到登录屏幕。
登录屏面完成后，分析结果保存令牌并导航至下一片段主屏面。
当在主屏幕中按下返回按钮时，您将向启动屏幕发回一条结果消息，指示其完成应用程序。
要弹出1个片段并导航到另一个片段，可以使用以下代码：

val nextDestination = if (loginSuccess) {
        R.id.action_Dashboard
    } else {
        R.id.action_NotAuthorized
    }

val options = NavOptions.Builder()
        .setPopUpTo(R.id.loginParentFragment, true)
        .build()

findNavController().navigate(nextDestination, null, options)