我想这不是人们会做的事。
我已经满足于只运行两次命令;我的工作咒语是这样的

bootstrap
b2 -j8 --build-dir=build               toolset=msvc-14.0 variant=debug,release link=shared threading=multi runtime-link=shared                  stage
b2 -j8 --build-dir=build --buildid=x64 toolset=msvc-14.0 variant=debug,release link=shared threading=multi runtime-link=shared address-model=64 stage

这将把x86和x64库放入stage\lib;对于实际编译应用程序，只需要此文件夹和boost文件夹的内容。然后在构建软件时，将此片段添加到项目文件中（通过props文件）：

<PropertyGroup>
    <BoostIncludeDir>path\to\include\boost\</BoostIncludeDir>
    <BoostLibDir>path\to\lib\</BoostLibDir>
</PropertyGroup>
<ItemDefinitionGroup>
  <ClCompile>
    <AdditionalIncludeDirectories>$(BoostIncludeDir);%(AdditionalIncludeDirectories)</AdditionalIncludeDirectories>
    <PreprocessorDefinitions>BOOST_ALL_DYN_LINK;%(PreprocessorDefinitions)</PreprocessorDefinitions>
    <PreprocessorDefinitions Condition="'$(Platform)'=='x64'">BOOST_LIB_BUILDID=x64;%(PreprocessorDefinitions)</PreprocessorDefinitions>
  </ClCompile>
  <Link>
      <AdditionalLibraryDirectories>$(BoostLibDir);%(AdditionalLibraryDirectories)</AdditionalLibraryDirectories>
  </Link>
</ItemDefinitionGroup>

（BOOST_ALL_DYN_LINK在技术上是可选的，但如果您正在编译在其导出的API中具有Boost类型的DLL，则它有助于提高兼容性。但是，您仍然需要确保它们都是使用相同的编译器和Boost版本编译的。）

由于人们在多年后仍然明显地发现这个问题和答案，我可能应该补充说，从Boost 1.67开始，不再需要使用自定义构建ID或构建两次;你可以在一个单独的咒语中为32位和64位构建：

bootstrap
b2 -j8 --build-dir=build toolset=msvc-14.1 cxxflags="-std:c++17" variant=debug,release link=shared threading=multi runtime-link=shared address-model=32,64 stage

props文件本质上是相同的，但没有必要再定义BOOST_LIB_BUILDID。
然而，如果你出于其他原因想要多个自定义构建，那么这个被接受的答案可能仍然是你感兴趣的。