Bundler 1.7有一个新功能，允许您通过将特定的gem嵌套在一个块中来选择它们的来源：

source "https://rubygems.org"

gem 'gemfromrubygems1' 
gem 'gemfromrubygems2'

source "http://our.own.gem.repo.com/the/path/to/it" do
  gem 'gemfromourrepo'
end

或将其指定为选项：

source "https://rubygems.org"

gem 'gemfromrubygems1' 
gem 'gemfromrubygems2'

gem 'gemfromourrepo', source: "http://our.own.gem.repo.com/the/path/to/it"

有关详细信息，请参见http://bundler.io/v1.7/gemfile.html。

根据Gemfile手册页中的Source Priority部分，从最后输入到第一次输入的顺序搜索源。
根据你所说的，听起来你想总是喜欢你的gem而不是rubygems.org。只要你不需要改变你的偏好（例如，一些dup来自rubygems.org，一些dup来自你的私人repo），那么你的问题就可以简单地通过以下Gemfile解决：

source 'https://rubygems.org'
source 'http://our.own.gem.repo.com/the/path/to/it'

gem 'gemfromrubygems1'  
gem 'gemfromrubygems2'
gem 'gemfromourrepo'

我发现的唯一方法似乎是一个可怕的黑客。
Bundler将从最后列出的源代码开始搜索您的gem的最佳版本，然后搜索之前列出的所有源代码。源代码行相对于gem行的位置无关紧要，只是相对于彼此。
我尝试使用：git和：path来使它工作，但这两个都不适用于gemservers。
如果您将gem的版本设置为2.mine.1并将其推送到服务器，则可以在Gemfile中约束该版本。

source :rubygems
source 'http://myrepo'    
gem 'gemfromourrepo', '~> 2.ourrepo'

那么最匹配的版本应该是你的服务器上的一个。有可能有人会把自己的同名gem 2.ourrepo.2推到rubygems上，但如果它是唯一的，那就不太可能了。

path命令可能会有所帮助，它允许您设置gem特定的源代码

gem "foo", "1.0", :path => "bar"

来源：http://bundler.io/v1.3/man/gemfile.5.html