Survminer -排列多个ggsurvplot和ggadjustedcurves

k4ymrczo  于 2023-04-09  发布在  其他
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我想合并survminer图(如arrange_ggsurvplots()):ggsurvplot(对于Kaplan Meier模型)和ggadjustedcurves(对于考克斯)。

library(survminer)
fitKM  <- survfit(Surv(time, status) ~ sex, data = lung)
fitCox <- coxph(Surv(time, status) ~ sex, data = lung)
p1 = ggsurvplot(fitKM, data = lung)
p2 = ggadjustedcurves(fitCox, data = lung,variable = "sex")

当我这样做:

arrange_ggsurvplots(x = list(p1,p2))

我有

Error in FUN(X[[i]], ...) : An object of class ggsurvplot is required.

我该怎么做?

k10s72fa

k10s72fa1#

ggsurvplot对象是一个list,其中生存曲线的图存储为名为plot的元素,即ggplot对象,而ggadjustedcurves默认返回ggplot对象。
因此,合并两个图的一个选项是使用ggplot对象的可用选项之一,例如patchwork

library(survminer)
library(survival)

fitKM  <- survfit(Surv(time, status) ~ sex, data = lung)
fitCox <- coxph(Surv(time, status) ~ sex, data = lung)
p1 = ggsurvplot(fitKM, data = lung)
p2 = ggadjustedcurves(fitCox, data = lung, variable = "sex")

library(patchwork)

p1$plot + p2

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