linux 我想在维也纳RNA包中使用RNAplot命令

icnyk63a  于 2023-04-11  发布在  Linux
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我想画我的RNA点括号符号文件的RNA二级结构圆图。我已经用conda install下载了维也纳RNA。当然,我已经阅读了RNAplot文档。(https://www.tbi.univie.ac.at/RNA/RNAfold.1.html)但是我仍然不能使用RNAplot命令。
如何在linux下使用RNAplot命令绘制RNA二级结构圆图?
谢谢大家。
我想在linux下用RNAplot命令绘制RNA二级结构圆图。

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要在Linux下使用RNAplot命令绘制RNA二级结构圆图,可以按照以下步骤操作:
打开终端或命令提示符,然后导航到点括号表示法文件所在的目录。
键入以下命令为RNA二级结构生成PostScript输出文件:
RNAplot -o ps<input_file>
替换<input_file>为点括号表示法文件的名称。此命令在同一目录中生成名为www.example.com的PostScript文件rna.ps。
要查看RNA二级结构圆形图,您需要将PostScript文件转换为可查看的格式。您可以通过键入以下命令来执行此操作:
ps2pdfrna.ps
此命令在同一目录中生成一个名为rna.pdf的PDF文件。
要查看圆形图,您可以使用PDF查看器(如Adobe Acrobat Reader)打开PDF文件。如果要更改圆形图的大小或颜色,可以在RNAplot命令中使用-W和-C选项。例如,要将圆形图的大小更改为10 cm,可以使用以下命令:
RNAplot -o ps -W 10<input_file>
我希望这有帮助!

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