这是真的。Sqlite不是为这类应用程序构建的。Sqlite实际上是为轻量级单线程、单示例应用程序构建的。
Sqlite连接是每个示例一个，如果你开始进入某种线程多路复用器（参见https://www.sqlite.org/threadsafe.html），这是可能的，但它比它的价值更麻烦。还有其他提供该功能的解决方案-看看Postgresql或MySQL。这些数据库是开源的，有很好的文档，很好的支持，并支持你需要的并发类型。

我不确定SQLAlchemy是如何处理连接的，但是如果你使用的是PeeweeORM，那么解决方案就很简单了。
当你的Flask应用发起一个请求时，你将打开一个到DB的连接。然后当Flask发送响应时，你将关闭DB。
类似地，在cron脚本中，在开始使用DB时打开一个连接，然后在进程结束时关闭它。
另一件你可以考虑的事情是在WAL模式下使用SQLite。这可以提高并发性。当你打开你的连接时，你可以用一个PRAGMA查询来设置日志模式。
有关详细信息，请参阅http://charlesleifer.com/blog/sqlite-small-fast-reliable-choose-any-three-/

对于未来的读者-解决方案是双重的。
1.您需要手动管理异常，等待并重试-类似于以下内容：

# retry
record = None
for i in range(3):
    try:
        my.sqlite.function()
        break # break out of the retry loop on success
    except sqlite3.OperationalError:
        time.sleep(0.01)
if not record:
    raise BigError("Bad!")

2：您需要启用WAL或Write Ahead Logging模式。这将使您能够在写入时读取数据库中已有的内容。