自Symfony 3.3起，不建议使用替换。您应该尝试使用别名代替替换服务。http://symfony.com/doc/current/service_container/alias_private.html
你也可以试试这个方法：
执行$container->set()之前的$this->container->getDefinition('user.user_service')->setSynthetic(true);
在php 7.2的测试中替换Symfony服务

最后，我找到了一个解决方案。也许不是最好的，但是，它起作用了：
我创建了另一个测试容器类，并使用Reflection覆盖了services属性：

<?php

namespace My\Bundle\Test;

use Symfony\Bundle\FrameworkBundle\Test\TestContainer as BaseTestContainer;

class TestContainer extends BaseTestContainer
{
    private $publicContainer;

    public function set($id, $service)
    {
        $r = new \ReflectionObject($this->publicContainer);
        $p = $r->getProperty('services');
        $p->setAccessible(true);

        $services = $p->getValue($this->publicContainer);

        $services[$id] = $service;

        $p->setValue($this->publicContainer, $services);
    }

    public function setPublicContainer($container)
    {
        $this->publicContainer = $container;
    }

Kernel.php：

<?php

namespace App;

use Symfony\Component\HttpKernel\Kernel as BaseKernel;

class Kernel extends BaseKernel
{
    use MicroKernelTrait;

    public function getOriginalContainer()
    {
        if(!$this->container) {
            parent::boot();
        }

        /** @var Container $container */
        return $this->container;
    }

    public function getContainer()
    {
        if ($this->environment == 'prod') {
            return parent::getContainer();
        }

        /** @var Container $container */
        $container = $this->getOriginalContainer();

        $testContainer = $container->get('my.test.service_container');

        $testContainer->setPublicContainer($container);

        return $testContainer;
    }

很难看，但很有效。

我有几个这样的测试（真实的的代码执行一些操作并返回结果，测试版本只是对每个答案返回false）。
如果您为每个环境创建并使用自定义配置（例如：一个services_test.yaml，或者在Symfony 4中可能是tests/services.yaml），并首先让它包含dev/services.yaml，但随后覆盖所需的服务，将使用最后一个定义。
app/config/services_test.yml：

imports:
    - { resource: services.yml }

App\BotDetector\BotDetectable: '@App\BotDetector\BotDetectorNeverBot'

# in the top-level 'live/prod' config this would be 
# App\BotDetector\BotDetectable: '@App\BotDetector\BotDetector'

在这里，我使用一个接口作为一个服务名称，但它也会做同样的'@service.name'样式。

正如我所理解的，这意味着类X已经被注入（由于其他一些依赖关系）在您的代码试图用self::$container->set(X:class, $someMock)覆盖它之前。

对这个问题的所有答案似乎都忽略了Symfony更换服务的完整历史：
1.在Symfony 3.2之前，即使在初始化后也可以替换服务。

1. Symfony 3.2 deprecated能够用$service->set()替换服务，即使是出于测试目的。
   1.在一些社区反馈中，DX在测试中被弃用，用$service->set()替换服务的能力是restored in 3.3.10，但有一个限制，即被替换的服务必须没有被“初始化”。换句话说，服务必须尚未注入到其他服务中（因为容器很难知道如何重新初始化所有服务的整个图，如果这样的服务被替换的话）。
   因此，如果您收到The "my.service" service is already initialized, you cannot replace it.消息，这意味着以下两件事之一：
   1.您试图替换的服务已用于初始化另一个服务。您可能需要在测试的早期替换该服务，或者重新排列测试中初始化服务的顺序。
2. （未在任何地方记录）您正在尝试替换lazy服务。惰性服务在定义后立即由容器注入一个惰性加载存根，这会导致容器将其视为已初始化。作为一种解决方法，在services_test.yaml文件中将lazy服务定义为非惰性。我通过单步执行具有惰性服务的项目中的代码发现了这一点，这是我不得不使用的变通方法。

如果您使用Symfony 3.4及以下版本，您可以在容器中进行服务，无论它是私有的还是公共的。只会发出deprication通知，内容类似于问题的错误消息。
在Symfony 4.0上，发现了问题的错误。
但是在Symfony 4.1及更高版本上，你可以依靠特殊的“测试”容器。要学习如何使用它，请考虑以下链接：

• https://symfony.com/blog/new-in-symfony-4-1-simpler-service-testing
• https://dev.to/nikolastojilj12/symfony-5-mocking-private-autowired-services-in-controller-functional-tests-24j4