如果我没有理解错的话，通常会有（最多）五个类别“a”-“e”，并且您希望这些类别的形状和颜色在数据集之间保持一致。gg_color_hue(...)来自here）：

# set up shapes
shapes <- c(15,18,16,17,19)
names(shapes) <- letters[1:5]

# set up colors
gg_color_hue <- function(n) { # ggplot default colors
  hues = seq(15, 375, length=n+1)
  hcl(h=hues, l=65, c=100)[1:n]
}
colors <- gg_color_hue(5)
names(colors) <- names(shapes)

# original data
ggplot(ABC, aes(x=B ,y=C ,size=D, colour=types,label=types, shape=types)) +
  geom_point()+geom_text(size=2, hjust=0,colour="black", vjust=0) +
  scale_size_area(max_size=20, "D", breaks=c(100,500,1000,3000,5000))  +
  scale_x_log10(lim=c(0.05,10),breaks=c(0.1,1,10))+ 
  scale_y_continuous(lim=c(0,30000000)) +
  scale_shape_manual(values=shapes) + scale_color_manual(values=colors)

#new data
DEF <- data.frame(B,C,D,types=factor(c("a","a","a","d","e")))
ggplot(DEF, aes(x=B ,y=C ,size=D, colour=types,label=types, shape=types)) +
  geom_point()+geom_text(size=2, hjust=0,colour="black", vjust=0) +
  scale_size_area(max_size=20, "D", breaks=c(100,500,1000,3000,5000))  +
  scale_x_log10(lim=c(0.05,10),breaks=c(0.1,1,10))+ 
  scale_y_continuous(lim=c(0,30000000)) +
  scale_shape_manual(values=shapes) + scale_color_manual(values=colors)

我敢肯定，这是不再相关的OP，但最好的解决方案，我发现这个问题是简单的比什么是目前张贴和几乎写入问题本身。
操作员希望使用类似的方法指定手动定义的形状或颜色
“scale_shape_manual(values=('a'=15, 'b'=18, 'c'=16, 'd'=17, 'e'=19))“
只要求赋值作为向量传递，
scale_shape_manual(values = c('a'=15, 'b'=18, 'c'=16, 'd'=17, 'e'=19))
如果你想自动生成颜色，jlhoward的答案更好。而我下面提供的脚本需要更少的代码行。用户选择。

A <- c('a','b', 'c','d','e')
types <- factor(A)
B <- c(1,2,3,4,5)
C <- c(6,7,8,9,10)
D <- c(1,2,1,2,3)
ABC <- data.frame(B,C,D,types)

library(ggplot2)

ggplot(ABC, aes(x=B ,y=C ,size=D, colour=as.factor(types),label=types, shape=as.factor(types))) +
geom_point()+geom_text(size=2, hjust=0,colour="black", vjust=0) +
scale_size_area(max_size=20, "D", breaks=c(100,500,1000,3000,5000))  +
scale_x_log10(lim=c(0.05,10),breaks=c(0.1,1,10))+
scale_y_continuous(lim=c(0,30000000)) +
scale_shape_manual(values = c('a'=15, 'b'=18, 'c'=16, 'd'=17, 'e'=19)) +
scale_colour_manual(values = c('a'="tomato", 'b'="yellow4", 'c'="palegreen2", 'd'="deepskyblue1", 'e'="orchid3"))`