纯bash：

for file in *_*_*_*_*.fastq.gz; do
    head=${file%%_*}
    tail=${file#*_*_*_}
    echo mv "$file" "${head}_${tail}" # Drop the echo if the output looks good
done

在POSIX shell中也可以使用。您不必调用外部实用程序（如sed或awk）。Bash和POSIX shell具有执行这种字符串操作的内置支持。

您需要循环查看文件名。在bash中，这将是：

for f in *.fastq.gz ; do
    newf=$(echo $f|  sed 's/\([^_]*\)_[^_]*_[^_]*_\(.*\)/\1_\2/')
    echo "mv $f $newf"
done

看看输出。如果你对bash不是很有经验，那么先试试echo是个好主意。否则，如果你犯了错误，你可能会得到不想要的结果。
当您对新名称的正确性感到满意时，请将

echo "mv $f $newf

与

mv "$f" "$newf"