python 在google colab上安装graph-tool软件包时出现问题

btxsgosb  于 2023-05-05  发布在  Python
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我按照以下链接中的图形工具安装说明进行了操作(https://colab.research.google.com/github/count 0/colab-gt/blob/master/colab-gt.ipynb#scrollTo=d_j7nNbKRmhx)。但是,它会引发以下错误

<ipython-input-3-3f634eeb007c> in <module>()
----> 1 state.draw()

/usr/lib/python3/dist-packages/graph_tool/inference/nested_blockmodel.py in draw(self, **kwargs)
    986         draws the hierarchical state."""
    987         import graph_tool.draw
--> 988         return graph_tool.draw.draw_hierarchy(self, **kwargs)
    989 
    990 

AttributeError: module 'graph_tool.draw' has no attribute 'draw_hierarchy' ```
mm5n2pyu

mm5n2pyu1#

下面的命令为我工作。这个问题是由于一些与cairo lib的依赖。

!apt-get install libcairo2-dev 
!pip install pycairo

在查找日志时,我还注意到import gi有一个链接错误。它也被引入。

!sudo echo "deb http://downloads.skewed.de/apt bionic main" >> /etc/apt/sources.list
!sudo apt-key adv --keyserver keys.openpgp.org --recv-key 612DEFB798507F25
!sudo apt-get update
!sudo apt-get install python3-graph-tool python3-matplotlib
!sudo ln -s /usr/lib/python3/dist-packages/gi/_gi.cpython-{36m,37m}-x86_64-linux-gnu.so
ljsrvy3e

ljsrvy3e2#

我遇到了同样的问题,我找到了解决方案。首先,你必须将python版本降级到3.7(在cola中,默认为3.10)然后,安装上面其他答案中的所有依赖项。然后
apt-get install python3-cairo
对我来说,确实有效

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