git stash store "$(git stash create)"
将创建类似于git stash的stash条目，而无需实际接触和清除工作目录和索引。
如果你检查stash list或者查看所有提交图（包括stash），你会发现它的结果与你正常调用git stash得到的结果相似。只是stash list中的消息不同（通常类似于 “stash@{0}：主文件上的WIP：14 e009 e init commit”，此处我们将获取 “stash@{0}：通过“git stash store”创建”）

$ git status --short
M file.txt
A  file2.txt

$ git stash list

$ git stash store "$(git stash create)"

$ git stash list
stash@{0}: Created via "git stash store".

$ git stash show 'stash@{0}'
 file.txt  | 2 +-
 file2.txt | 2 ++
 2 files changed, 3 insertions(+), 1 deletion(-)

$ git log --oneline --graph --all
*   85f937b (refs/stash) WIP on master: 14e009e init commit
|\
| * 26295a3 index on master: 14e009e init commit
|/
* 14e009e (HEAD -> master) init commit

$ git status
M file.txt
A  file2.txt

再解释一下：
一个git stash条目是用一些定义好的结构的普通提交来表示的。基本上，它是一个有2个父对象的常规提交对象（如果使用--include-untracked选项，则有3个）（更多信息1，2）。
git stash create创建这个表示stash条目的提交，并返回提交对象（有2或3个父对象）的对象名称（SHA-1）。这是一个悬置提交（您可以通过在git stash create之后调用git fsck来验证它）。你需要让refs/stash指向这个悬空提交，你可以通过git stash store来完成（或者像其他答案一样通过git update-ref，因为git stash store使用git update-ref来完成它的工作）。
最好看看git stash push的实际源代码，看到它基本上是调用git stash create和git stash store，然后执行一些逻辑来清理文件（哪一个取决于你在git stash push中使用了什么选项）。

多亏了Charles的建议，我创建了一个bash脚本来完成我想要的任务（我在实现这个别名时遇到了问题）。它接受一个可选的stash消息，就像git stash保存一样。如果没有提供，它将使用git stash生成的默认消息。

#!/bin/sh
#
# git-stash-snap
# Save snapshot of working tree into the stash without modifying working tree.
# First argument (optional) is the stash message.
if [ -n "$1" ]; then
        git update-ref -m "$1" refs/stash "$(git stash create \"$1\")"
else
        HASH=`git stash create`
        MESSAGE=`git log --no-walk --pretty="tformat:%-s" "$HASH"`
        git update-ref -m "$MESSAGE" refs/stash "$HASH"
fi

编辑：正如下面的注解中所指出的，将此脚本保存为路径中的git-stash-snap就足以通过键入git stash-snap来调用它。
这里的好处是，即使你删除了一个用这个方法创建的stash，你仍然可以通过dangling commit的git log [commit-hash]看到stash消息！
编辑：从git 2.6.0开始，你可以将--create-reflog添加到update-ref，然后git stash list会显示这个，即使之前没有使用过git stash。
编辑：Git引入了一个新的stash子命令stash push，所以我将这个脚本的名字从git-stash-push更新为git-stash-snap。

您需要将消息传递给update-ref，而不是stash create，因为stash create不接受消息（它不更新任何引用，因此没有要填充的reflog条目）。

git update-ref -m "Stash message" refs/stash "$(git stash create)"

下面将answer by @Mariusz Pawelski和a similar answer结合到一个相关的问题中，让您轻松地隐藏消息。

使用git stash store和消息

1.使用git stash create创建一个stash提交，然后使用git stash store将其保存到stash。这不会更改工作树中的任何文件。您可以添加一条有用的消息，以便稍后再次查找正确的版本。总计：

git stash store -m "saving intermediate results: my note 1" $(git stash create)

1.当您决定要丢弃当前的工作并恢复到以前的隐藏状态时，首先执行另一个git stash。这将“丢弃”任何未提交的更改，将它们隐藏在存储中，以便在接下来的步骤中应用另一个存储状态时不会发生合并冲突。

git stash

1.现在查看您保存在您的stash ref中的内容：

$ git stash list

stash@{0}: saving intermediate results: my note 1
stash@{1}: saving intermediate results: my note 2

1.最后，要恢复到隐藏的先前工作状态，* 丢弃当前工作树状态 *，您可以这样做：

git stash apply 1

而不是1，选择要恢复的stash commit的索引号，如上一步列表中stash@{…}中所示。
1.如果你发现你想要回你扔掉的工作：它也被保存在藏匿处，并且可以用与上述相同的技术来恢复。

封装为Git别名

上面步骤1中使用的命令可以与git别名一起使用，以使其更方便。创建别名（注意final # technique）：

git config --global alias.stash-copy \
  '!git stash store -m "saving intermediate results: $1" $(git stash create) #'

从现在开始，你可以像这样使用Git别名：

git stash-copy "my note"

受艾略特解决方案的启发，我将他的脚本扩展了一点：

#!/bin/sh
#
# git-stash-push
# Push working tree onto the stash without modifying working tree.
# First argument (optional) is the stash message.
#
# If the working dir is clean, no stash will be generated/saved.
#
# Options:
#   -c "changes" mode, do not stash if there are no changes since the
#      last stash.
if [ "$1" == "-c" ]; then
        CHECK_CHANGES=1
        shift
fi

if [ -n "$1" ]; then
        MESSAGE=$1
        HASH=$( git stash create "$MESSAGE" )
else
        MESSAGE=`git log --no-walk --pretty="tformat:%-s" "HEAD"`
        MESSAGE="Based on: $MESSAGE"
        HASH=$( git stash create )
fi

if [ "$CHECK_CHANGES" ]; then
        # "check for changes" mode: only stash if there are changes
        # since the last stash

        # check if nothing has changed since last stash
        CHANGES=$( git diff stash@{0} )
        if [ -z "$CHANGES" ] ; then
                echo "Nothing changed since last stash."
                exit 0
        fi
fi

if [ -n "$HASH" ]; then
        git update-ref -m "$MESSAGE" refs/stash "$HASH"
        echo "Working directory stashed."
else
        echo "Working tree clean, nothing to do."
fi

我对艾略特的脚本实现了以下更改：
1.当工作目录为干净时，脚本将正常退出
1.当使用开关-c时，如果与上一次stash相比没有变化，脚本将退出。如果您将此脚本用作“时间机器”，每隔10分钟自动进行一次存储，则此功能非常有用。如果没有任何变化，则不会创建新的stash。如果没有这个开关，你可能会得到n个连续的相同的stashes。
并不是说，为了使交换机-c正常工作，至少必须存在一个stash，否则脚本会在git diff stash@{0}上抛出错误并且什么都不做。
我将此脚本用作“时间机器”，使用以下bash循环每10分钟进行一次快照：

while true ; do date ; git stash-push ; sleep 600 ; done