我以为它已经存在了一段时间，但根据this，
MySQL 5.7.4引入了为顶级只读SELECT语句设置服务器端执行时间限制的功能，以毫秒为单位。

SELECT 
/*+ MAX_EXECUTION_TIME(1000) */ --in milliseconds
* 
FROM table;

请注意，这只适用于只读SELECT语句。

**更新：**该变量在MySQL 5.7.4中增加，在MySQL 5.7.8中重命名为max_execution_time。（资料来源）

如果你使用的是mysql native driver（从php 5.3开始就很常见）和mysqli扩展，你可以通过一个异步查询来完成这个任务：

<?php

// Heres an example query that will take a long time to execute.
$sql = "
    select *
    from information_schema.tables t1
    join information_schema.tables t2
    join information_schema.tables t3
    join information_schema.tables t4
    join information_schema.tables t5
    join information_schema.tables t6
    join information_schema.tables t7
    join information_schema.tables t8
";

$mysqli = mysqli_connect('localhost', 'root', '');
$mysqli->query($sql, MYSQLI_ASYNC | MYSQLI_USE_RESULT);
$links = $errors = $reject = [];
$links[] = $mysqli;

// wait up to 1.5 seconds
$seconds = 1;
$microseconds = 500000;

$timeStart = microtime(true);

if (mysqli_poll($links, $errors, $reject, $seconds, $microseconds) > 0) {
    echo "query finished executing. now we start fetching the data rows over the network...\n";
    $result = $mysqli->reap_async_query();
    if ($result) {
        while ($row = $result->fetch_row()) {
            // print_r($row);
            if (microtime(true) - $timeStart > 1.5) {
                // we exceeded our time limit in the middle of fetching our result set.
                echo "timed out while fetching results\n";
                var_dump($mysqli->close());
                break;
            }
        }
    }
} else {
    echo "timed out while waiting for query to execute\n";

    // kill the thread to stop the query from continuing to execute on 
    // the server, because we are abandoning it.
    var_dump($mysqli->kill($mysqli->thread_id));
    var_dump($mysqli->close());
}

我给mysqli_query赋予的标志完成了重要的事情。它告诉客户端驱动程序启用异步模式，同时迫使我们使用更详细的代码，但允许我们使用超时（如果需要，还可以发出并发查询！）另一个标志告诉客户端不要将整个结果集缓冲到内存中。
默认情况下，php配置它的mysql客户端库，在它允许php代码开始访问结果中的行之前，将查询的整个结果集取入内存。这可能需要很长时间才能传输大型结果。我们禁用它，否则在等待缓冲完成时可能会超时。
请注意，有两个地方需要检查是否超过时间限制：

• 实际的查询执行
• 在获取结果（数据）时

您可以在PDO和常规mysql扩展中完成类似的操作。它们不支持异步查询，因此您无法设置查询执行时间的超时。但是，它们支持无缓冲的结果集，因此您至少可以在获取数据时实现超时。
对于许多查询，mysql几乎可以立即开始将结果流式传输给您，因此单独使用无缓冲查询将允许您在某些查询上有效地实现超时。例如，一个

select * from tbl_with_1billion_rows

可以立即开始流式传输行，但是，

select sum(foo) from tbl_with_1billion_rows

在开始向您返回第一行之前，需要处理整个表。在后一种情况下，异步查询的超时可以保存您的时间。它也会把你从普通的老僵局和其他东西中拯救出来。
ps -我没有在连接本身包含任何超时逻辑。

请将您的查询改写为
select /*+ MAX_EXECUTION_TIME(1000) */ * from table
此语句将在指定时间后终止查询

你可以在另一个命令上找到答案。问题：
MySQL - can I limit the maximum time allowed for a query to run?
在数据库服务器上每秒运行一次的cron作业，连接并执行如下操作：

• 展会流程员
• 查找查询时间大于所需最大时间的所有连接
• 对每个进程运行KILL [processid]

pt_kill有这样的选项。但它是按需进行的，而不是持续监测。它做了@Rafa建议的事情。但是，请参阅--sentinel，了解如何接近cron。

您可以从Linux命令行运行下面的一行程序，甚至可以将其插入crontab以定期运行。
这个例子将立即杀死所有运行至少1小时（3600秒）的SELECT查询：

mysql -e "SELECT group_concat(concat('KILL ',id,';') separator ' ') AS cmd FROM information_schema.processlist WHERE user NOT IN ('slave','replica') AND info LIKE 'SELECT %' AND time > 3600;" | grep KILL | mysql

从上面的内容来看，您可能需要替换：
NOT IN (["safe list" of mysql users you NEVER want to touch; e.g. replication users])
time > [N seconds for slow queries you want to target]
注意：盲目运行KILL命令会导致错误的效果。请谨慎使用！