您可以使用permissions create方法授予用户对文件的访问权限，而不是将文件公开。
应该是这样的。如果它不起作用，请告诉我，我没有时间测试它。

const emails = ['SomeEmail@gmail.com', ];
for (let i = 0; i < emails.length; i++) {
  const res = await drive.permissions
    .create({
      resource: {
        role: "writer",
        type: "user",
        emailAddress: emails[i],
      },
      fileId: fileId,
      sendNotificationEmail: true,
      fields: "id",
    })
    .catch((err) => console.log(err.errors));
  if (res) console.log(res.data);
}

要将文件常规访问权限从Anyone with the link更改为Restricted，可以使用permissions.delete方法。
我目前无法使用node.js进行测试，但根据示例，请求看起来像这样：

drive.permissions
  .delete({
    fileId: fileId, 
    permissionId: "anyoneWithLink"
  }

另外，在您的评论中，我看到您由于错误"Sorry, cannot transfer ownership to user@email.com. Ownership can only be transferred to another user in the same organization as the current owner."而在转移文件所有权时遇到问题
此行为是由于Google云端硬盘的工作方式，因为您无法将文件所有权转移到其他域。
已知限制和替代方案
您无法将所有权转让给外部用户，例如个人Google帐户或其他组织中的用户。此限制旨在保护用户和公司数据免受未经授权的传输和访问。根据您组织的共享策略，您可以使用以下替代方案。

参考资料

• Method: permissions.delete
• 以管理员身份将驱动器文件传输给新所有者