同样，我也遇到了node_modules排除的问题。
这里有一个笨拙的解决方案，它忽略了所有的*.d.ts文件。
在compilerOptions中添加：

"compilerOptions": {
    "skipLibCheck": true,
    ...
 }

相关：

• https://www.typescriptlang.org/tsconfig#compilerOptions

Typescript将拉入项目文件中import语句引用的任何路径。
如果您看到正在处理的文件是您已经“排除”的，那么请检查其他代码中对它们的引用。

我发现在要排除的目录之前添加两个星号和一个斜杠（**/）解决了这个问题，编辑tsconfig文件如下：

{
...
  "exclude": [
    "**/node_modules",
    "**/typings"
  ]
...
}

好的，如果你已经尝试了其他所有方法，检查一下你的代码库中没有导入导致“排除”代码的语句。如果您在Typescript作用域中包含一个从（例如）“compiled-src”导入文件的文件，则导入的所有文件将突然被包含在内。这可能会产生多米诺骨牌效应，使exclude属性看起来没有得到尊重。
具体来说，我使用intellisense从我的代码库中自动导入一些东西，intellisense决定优先使用compiled-src中的文件而不是typescript文件。我没有注意到，过了很久才意识到发生了什么。

我确实看到这是一段时间以前的事了，而且你已经接受了一个答案，但我想补充以下内容，这里有记录：
“**重要提示：**exclude only 会更改由于include设置而包含的文件。”
由于tsconfig中没有include设置，因此exclude设置不会产生任何影响。

我也有同样的问题。把头发拔了大约30分钟，然后发现如果我改变：

"target": "ES5",

至

"target": "ES6",

所有的错误都消失了！

我做到了：

git clone https://github.com/czechboy0/Express-4x-Typescript-Sample.git
cd Express-4x-Typescript-Sample/
./run.sh
tsd install  # I don't know why, but this helped me.
./run.sh

我创建了包含内容的Express-4x-Typescript-Sample/tsconfig.json文件

{
  "compilerOptions": {
    "target": "ES5",
    "module": "commonjs",
    "moduleResolution": "node",
    "sourceMap": true,
    "emitDecoratorMetadata": true,
    "experimentalDecorators": true,
    "removeComments": false,
    "noImplicitAny": false
  },
  "exclude": [
    "node_modules",
    "typings"
  ]
}

我跑了

[...]/Express-4x-Typescript-Sample$ tsc -p .

而且它能让我工作--也就是说。不存在错误。

我遇到了这个问题，我的exclude看起来像这样：

"exclude": [
  "node_modules",
  "typings"
]

当我删除"typings"时，它起作用了。我的最终解决方案：

"exclude": [
  "node_modules"
]

04/02/0217（4月2日）-我正在经历同样的事情，几乎花了整整一个周末。最后，我找到了这个网站（我从来没有见过任何stackoverflow帖子链接）：https://angular.io/docs/ts/latest/guide/typescript-configuration.html
在其中，我发现了这行，就在编译器选项中：

"lib": [ "es2015", "dom" ]

我不知道它是做什么的，在这一点上我不在乎，但我所有的node_modules错误都消失了。
至于include/exclude不起作用，我相信这是因为“依赖关系”。即使您排除了一个文件夹，如果导入的文件（如Component或NgModule）对node_modules中的文件有一些依赖关系，tsc将尝试编译该文件。