我已经与苹果技术开发人员支持讨论了这个问题。经过长时间的讨论，他们承认这是苹果方面的一个bug。已经升级到工程队了。
更新：Apple工程团队提供了关于此问题的以下信息，并为我工作：
我们能够通过在info.plist中添加NSSupportsAutomaticTermination = NO来防止退出行为

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这只有在激活“支持多个窗口”时才有可能：

我的想法，为什么会是这样：macOS区分了应用程序和Windows。因此，如果您的应用程序只能打开一个窗口，关闭该窗口将告诉macOS关闭应用程序。
PS：我在“支持多个窗口”模式下遇到了一些bug。我希望他们很快就会被删除。

以下是我的解决方案，也许有人还在寻找这个：）
首先，我们需要访问AppKit。在这个链接中，你可以找到一个很好的解释如何做到这一点，以及一些先睹为快的下一步。link
一旦我们准备好了AppKit包，并阅读了如何禁用窗口上的缩放按钮的说明（在上面的链接中），我们就准备好做我们真正想要的事情了;这是为了避免在点击关闭按钮时应用程序终止。为此，我们将简单地劫持关闭按钮，并告诉它做我们需要的...

- (void) tweakWindowButtons
{
    NSArray *windows = NSApplication.sharedApplication.windows;
    
    NSWindowCollectionBehavior behavior = NSWindowCollectionBehaviorFullScreenAuxiliary | NSWindowCollectionBehaviorFullScreenNone;
    
    for (NSWindow *window in windows) {
        [window setCollectionBehavior:behavior];
        
        //-- Hijack close button action
        NSButton *button = [window standardWindowButton:NSWindowCloseButton];
        [button setTarget:self];
        [button setAction:@selector(closeButtonAction)];
        
        button = [window standardWindowButton:NSWindowZoomButton];
        [button setEnabled:NO];
    }
}

- (void) closeButtonAction
{
        NSApplicationActivationPolicy policy = NSApplicationActivationPolicyAccessory;
        
        //-- hide app icon and window
        NSApplication.sharedApplication.activationPolicy = policy;
    }
}

要恢复视图，请将策略设置为NSApplicationActivationPolicyRegular
顺便说一句，我假设我们也有一个状态栏图标，将作为一个锚的应用程序。