我有一个非常简单的knitr Rnw脚本。当我在RStudio中运行它时,环境窗格显示全局环境为空,尽管脚本正确编译为pdf,并且变量的计算正确。
\documentclass{article}
\begin{document}
<<settings, echo=FALSE>>=
library(knitr)
a<-1+10
@
The outcome is equal to \Sexpr{a}.
\end{document}
直到最近,这一直都很好。我想知道这是否与一些RStudio设置或knitr选项有关。常规R脚本中的变量在环境窗格中显示良好。对于更复杂的knitr项目,能够查看变量可以使工作变得容易得多。
2条答案
按热度按时间3lxsmp7m1#
通常情况下,当您在RStudio中单击
knit
来编织文档时,它会在一个单独的R进程中运行,并且在完成时删除变量。你的代码块将无法看到环境中的变量,这些变量也不会被修改。有几种方法可以在当前进程中运行:将每个块作为代码运行,或者在主进程中运行
rmarkdown::render("somefilename.Rmd")
。然后,您的文档可以看到您当前的工作区,并在那里进行修改。对于调试,第二种方法很方便,但对于最终结果的可重复性,您应该运行单独的R进程。
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最后,这就是我的工作。我没有在RStudio中点击“Compile pdf”按钮,而是在控制台中运行了以下命令:
这是在这里推荐的:knitr: why does nothing appear in the "environment" panel when I compile my .Rnw file