假设在类路径中，在jar中目录以/json开始（/resource是根目录），它可能是这样的：

URL url = getClass().getResource("/json");
    Path path = Paths.get(url.toURI());
    Files.walk(path, 5).forEach(p -> System.out.printf("- %s%n", p.toString()));

这将使用jar:file://... URL，并在其上打开一个虚拟文件系统。
检查jar是否确实使用了该路径。
可以根据需要进行阅读。

BufferedReader in = Files.newBufferedReader(p, StandardCharsets.UTF_8);

首先，请记住，Jars是Zip文件，因此如果不解压缩它，您无法从中获取单个File。Zip文件并没有目录，所以这并不像获取目录的子目录那么简单。
这是一个有点困难的问题，但我也很好奇，经过研究，我想出了以下几点。
首先，您可以尝试将资源放入Jar中嵌套的平面Zip文件（resource/json/templates.zip）中，然后从该zip文件加载所有资源，因为您知道所有zip条目都将是您想要的资源。即使在IDE中也应该可以工作。

String path = "resource/json/templates.zip";
ZipInputStream zis = new ZipInputStream(getClass().getResourceAsStream(path));
for (ZipEntry ze = zis.getNextEntry(); ze != null; ze = zis.getNextEntry()) {
    // 'zis' is the input stream and will yield an 'EOF' before the next entry
    templateJson = (JSONObject) parser.parse(zis);
}

或者，您可以获取正在运行的Jar，遍历它的条目，收集resource/json/templates/的子条目，然后从这些条目中获取流。注意：* 这将只在运行Jar时起作用 *，添加一个检查，以便在IDE中运行时运行其他内容。

public void runOrSomething() throws IOException, URISyntaxException {
    // ... other logic ...
    final String path = "resource/json/templates/";
    Predicate<JarEntry> pred = (j) -> !j.isDirectory() && j.getName().startsWith(path);

    try (JarFile jar = new Test().getThisJar()) {
        List<JarEntry> resources = getEntriesUnderPath(jar, pred);
        for (JarEntry entry : resources) {
            System.out.println(entry.getName());
            try (InputStream is = jar.getInputStream(entry)) {
                // JarEntry streams are closed when their JarFile is closed,
                // so you must use them before closing 'jar'
                templateJson = (JSONObject) parser.parse(is);
                // ... other logic ...
            }
        }
    }
}

// gets ALL the children, not just direct
// path should usually end in backslash
public static List<JarEntry> getEntriesUnderPath(JarFile jar, Predicate<JarEntry> pred)
{
    List<JarEntry> list = new LinkedList<>();
    Enumeration<JarEntry> entries = jar.entries();

    // has to iterate through all the Jar entries
    while (entries.hasMoreElements()) {
        JarEntry entry = entries.nextElement();
        if (pred.test(entry))
            list.add(entry);
    }
    return list;
}

public JarFile getThisJar() throws IOException, URISyntaxException {
    URL url = getClass().getProtectionDomain().getCodeSource().getLocation();
    return new JarFile(new File(url.toURI()));
}

希望这能帮上忙。