python cdt(causal discovery toolbox)包中的CAM(causal additive model)的一些帮助

yyyllmsg 于 2023-05-27 发布在 Python

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当我尝试在cdt中启动CAM时总是有一个错误。密码在这里。

import networkx as nx
from cdt.causality.graph import CAM
from cdt.data import load_dataset
data, graph=load_dataset("sachs")
obj=CAM()

错误是File D：\anaconda\lib\site-packages\cdt\causality\graph\CAM.py：124 ininitraise ImportError（“R Package CAM is not available.”）
ImportError：R Package CAM不可用。
尝试在R中安装CAM包，并在www.example.com中更改rpathSetting.py，但没有使用。

python

来源：https://stackoverflow.com/questions/75171319/some-help-for-the-cam-causal-additive-model-in-cdt-causal-discovery-toolbox

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按热度按时间

sauutmhj1#

我所做的是创建一个小脚本来下载所有的R需求（因此R语言必须已经下载）。
我相信一个yaml文件仍然在项目文件夹中（可用的here）。
然而，这是我所做的：

from rpy2.robjects.packages import importr, data

utils = importr('utils')
base = importr('base')

with open('r_requirements.txt') as f:
    text = f.readlines()

for pack in text:
    utils.install_packages(pack)

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