因为你的代码是错误的，你试图分解一些不包含在你的数组中的东西，试试下面的代码：

<?php
$arr = [
    ["abc@test.com", "qwrt@sometest.com", "haritha@elitesin.com"],
    ["Kanishka.Kumarasiri@elitesin.com,Haritha@elitesin.com"],
    ["Kanishka.Kumarasiri@elitesin.com,test@elitesin.com"]
];
$allEmails = array();
foreach($arr as $array){
    foreach($array as $email){
        $allEmails[] = explode(",",$email);
    }
}
$new_value = array();    
foreach($allEmails as $array){
    foreach($array as $email){
        $new_value[] = strtolower($email);
    }
}

print_r (array_unique($new_value));

?>

您不需要添加任何更多的循环，只需在每次迭代中通过对explode()的返回值使用spread运算符将一个或多个元素推入结果数组。
如果您的任务需要区分大小写的唯一性，您可以非常简单地将未分解的字符串转换为小写。

$new_value = [];
foreach ($return_arr as $csv) {
    array_push($new_value, ...explode(",", strtolower($csv)));
}
var_export(array_unique($new_value));

这将是唯一值的平面数组。