根据perlop手册页（https://perldoc.perl.org/perlop）：
对于正则表达式运算符（qr//、m//和s///）的模式，\Q的引用是在处理插值之后、转义之前应用的。这允许模式按字面意思匹配（$和@除外）。例如，以下匹配：

'\s\t' =~ /\Q\s\t/

因为$或@触发插值，所以需要使用类似/\Quser\E\@\Qhost/的东西来匹配它们。
所以，在你的情况下，你可以写：

s/\Q.([])\E;,=\$\{var}/.([]);,=ok/

可以将阵列定义为：

echo '...${var}#other.([]);,=${var}#other${var}...' |
   perl -pe '$pattern=q|.([]);,=${var}|; s/\Q$pattern\E/.([]);,=ok/'
# output : ...${var}#other.([]);,=ok#other${var}...

\Q不会阻止插值。[1]
事实上，\Q通常被用作...\Q$var\E...，以匹配$var的字面值，我发现其他用法对阅读来说很费力。
为了便于阅读，在这种情况下，我会尝试使用以下代码：

perl -pe'my $text = q{.([]);,=${var}}; s/\Q$text/.([]);,=ok/'

1.它也没有引用分隔符（这就是为什么\E是可选的）。以及\L和\Q之后的类似工作。