要在awk中执行OS操作（例如，cp），您需要查看system()函数，例如：

awk -F"'" 'tolower($1) ~ /^include / {system("cp \"" $2 "\" dir1")}' main_file

由于这里的目标是执行操作系统级别的文件复制，因此在bash中执行此操作可能更简单...
添加一个名称中带有空格的文件，并创建文件/目录：

$ cat main_file
lines here
another line
Include 'file1'
include 'file2'
include 'file3 with spaces'
endoffile

$ touch file1 file2 'file3 with spaces'
$ mkdir dir1

一个想法：

while IFS="'" read -r _ fname _
do
    cp "$fname" dir1
done < <(grep -i '^include ' main_file)

在运行任意一组代码（awk，bash）之前：

$ ls -l dir1
                     # no output => nothing in directory

运行任意一组代码（awk，bash）后：

$ ls -l dir1
-rw-rw----+ 1 username None 30 Jun 29 10:50  file1
-rw-rw----+ 1 username None 90 Jun 29 10:50  file2
-rw-rw----+ 1 username None  0 Jun 29 10:50 'file3 with spaces'

**注意：**两种解决方案（awk、bash）都假定文件名始终用单引号括起来 *，并且 * 文件名不包含任何单引号

我想解释一下你的代码

awk 'tolower($1)=="include"{cp $2 dir1}' main_file

实际上是在做
tolower($1)=="include"进行不区分大小写的比较，这一点比 * 第一列是“include”或“Include”.*（将表示为$1=="include"||$1=="Include"）更敏感，因为它也适用于INCLUDE，InClUdE等，但如果这些没有出现或应该以相同的方式处理也是可以的。
{cp $2 dir1}进行字符串连接，因为cp和dir1没有定义，GNU AWK假设它们是空字符串。由于您没有指示GNU AWK如何处理连接的效果，因此没有打印任何内容（至少在我用于测试的GNU Awk 5.1.0中是这样）。
据我所知，GNU AWK没有复制文件的功能，但是你可以使用GNU AWK来准备bash的指令集，如下所示

awk 'tolower($1)=="include"{print "cp " $2 " dir1"}' main_file | bash

请记住，这样的解决方案很容易被破坏，因为它不关心dir1的存在，如果文件名中有'，可能会发生故障，所以如果可能的话，请考虑使用具有处理复制文件功能的语言。