获取分段错误从rpy2导入对象时核心转储错误

tzdcorbm 于 2023-07-31 发布在其他

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手动安装R和rpy2
安装成功，但出现上述错误。请帮帮我吧？
一些有用命令的输出：

>>> import rpy2
>>> rpy2.__path__
['/home/ashish/miniconda2/lib/python2.7/site-packages/rpy2-2.8.2-py2.7-linux-x86_64.egg/rpy2']
>>> import rpy2.robjects
cannot find system Renviron
/home/ashish/miniconda2/lib/python2.7/site-packages/rpy2-2.8.2-py2.7-linux- x86_64.egg/rpy2/rinterface/__init__.py:185: RRuntimeWarning: Fatal error: unable to open the base package

warnings.warn(x, RRuntimeWarning)
Segmentation fault (core dumped)

字符串
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来源：https://stackoverflow.com/questions/39347782/getting-segmentation-fault-core-dumped-error-while-importing-robjects-from-rpy2

1条答案

按热度按时间

dy2hfwbg1#

如果您通过conda安装rpy2，并且在同一台机器上也有R的系统安装（例如使用RStudio），则将使用系统的R安装。由于这个R版本与rpy2需要的版本不匹配，因此会出现分段错误。
1)删除所有现有的R系统安装（请参阅此处）。确认您没有安装任何R：

$>which R
R not found

字符串
2)定义R_HOME env变量，在.rc文件中：

export R_HOME=/Users/<your user>/anaconda3/envs/<env name>/lib/R

型
或者在Python项目中动态地：

import os
os.environ['R_HOME'] = '/Users/<your user>/anaconda3/envs/<env name>/lib/R'

型

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