我需要帮助修复错误
DESeqDataSet（se，design = design，ignoreRank）中的错误：设计公式中的所有变量必须是colData中的列
sample_info_tab数据计数_tab数据enter image description here
count_tab数据enter image description here
我使用的代码是
deseq_counts <- DESeqDataSetFromMatrix（count_tab，colData = sample_info_tab，design = ~type）
1条答案
按热度按时间tf7tbtn21#
据我所知，您选择的
design必须是元数据（sample_info_tab datacount_tab）中列的名称。在本例中，由于您输入了'type'，因此应确保在sample_info_tab datacount_tab文件中有一个名为'type'的列。尝试将设计更改为文件中某列的名称，该列将数据分隔成两个您想要比较的'types'，或者创建一个新列来这样做。此外，如果我是正确的，该函数也是大小写敏感的，所以一定要检查它是否真正匹配。祝你好运！