我正在尝试使用matplotlib来绘制我正在写的一篇论文的一些图形。我在2D numpy数组中有两组数据:一个ascii hillshade光栅,我可以很高兴地绘制和调整使用:
import matplotlib.pyplot as pp
import numpy as np
hillshade = np.genfromtxt('hs.asc', delimiter=' ', skip_header=6)[:,:-1]
pp.imshow(hillshade, vmin=0, vmax=255)
pp.gray()
pp.show()
字符串
其给出:
x1c 0d1x的数据
第二个ascii光栅描绘了流经景观的河流的特性。该数据可以以与上述相同的方式绘制,但是数组中不对应于河流网络的值被指定为无数据值-9999。目的是将“无数据”值设置为透明,以便河流值覆盖山体阴影。
这是河流数据,理想情况下,这里表示为0的每个像素都是完全透明的。
的
在这方面做了一些研究后,我似乎可以将我的数据转换为RGBA数组,并设置alpha值,使不需要的单元格透明。然而,river数组中的值是浮点数,不能被转换(因为原始值是图中的整个点),我相信imshow
函数在使用RGBA格式时只能接受无符号整数。
有没有办法绕过这个限制?我曾希望我可以简单地创建一个包含像素值和alpha值的元组,并像那样绘制它们,但这似乎不可能。
我还尝试使用PIL
创建一个河流数据的PNG文件,其中没有数据值是透明的,但是这似乎会自动将像素值缩放到0-255,从而丢失了我需要保留的值。
我欢迎任何人对这个问题的任何见解。
4条答案
按热度按时间vwhgwdsa1#
只需要mask你的“river”数组。
例如,在
字符串
作为以这种方式叠加两个图的快速示例:
型
的数据
另外,顺便说一下,
imshow
很乐意接受其RGBA格式的浮点数。它只是期望所有值都在0和1之间。o75abkj42#
另一种不使用掩码数组的方法是设置颜色Map如何处理低于
clim
最小值的裁剪值(无耻地使用Joe Kington的例子):字符串
的数据
还有一个
set_over
用于裁剪顶部,还有一个set_bad
用于设置颜色Map表如何处理数据中的“坏”值。这样做的一个优点是,您可以通过使用
im.set_clim([bot, top])
调整clim
来更改阈值wqsoz72f3#
另一种选择是将所有保持透明的单元格设置为
np.nan
(不知道这里哪个更有效,我猜基于clim
的tacaswell's answer将是最快的)。适配Joe Kington's answer示例:字符串
的数据
请注意,对于
dtype=bool
数组,您不应该遵循IDE的建议,为了PEP 8(E712)而比较masked_data is True
,而是坚持使用masked_data == True
进行元素比较,否则掩码将失败:的
zpjtge224#
另一种策略是导出河流分支网络。这通常是水文流量路由工具中的一个选项。我不确定你在这里使用了哪个工具,但下面是一个使用Python
pysheds
库的示例,它需要一个光栅类型文件,因此使用tiff文件而不是2D numpy数组:字符串
的数据