给定一个简单的Python脚本“test.py“：

from sys import stdout

stdout.write("text out")

字符串
使用system2()从R终端调用它可以正常工作：

python <- "C:/Users/username/Anaconda3/envs/general/python.exe"
script <- "C:/Users/username/Project Folder/test.py"
system2(command = python, args = shQuote(script), stdout = TRUE, stderr = FALSE)
# "text out"

型
但是在RStudio中运行相同的代码会返回一个空vector，并带有一个非零的退出警告：

system2(command = python, args = shQuote(script), stdout = TRUE, stderr = FALSE)
# character(0)
# attr(,"status")
# [1] 1
# Warning message:
# In system2(command = python, args = shQuote(script), stdout = TRUE,  :
#   running command '"C:/Users/username/Anaconda3/envs/general/python.exe" "C:/Users/username/Project Folder/test.py"' had status 1

型
其他故障排除显示：

• 在Rgui中，没有警告，但也只返回一个空向量。
• 如果Python脚本使用print()或尝试写入磁盘而不是stdout.write()，结果是相同的。
• 使用system(paste(shQuote(python), shQuote(script)))而不是system2()的结果是相同的。
• 在RStudio中使用system2()可以很好地运行系统命令或带参数的批处理文件--只是不能运行Python脚本。
• system2("printenv")显示了在R终端会话中而不是在RStudio中设置的一些env变量;但是在RStudio中使用Sys.setenv()设置这些并不能解决问题。sessionInfo()显示无明显差异。
• 如果RStudio以管理员权限运行，则问题仍然存在。

这个问题的背景是，我从来没有能够让网状在我的机器上工作，尽管定期尝试在几个版本的R和RStudio。这个问题似乎源于一个类似于上面reticulate:::python_config_impl()中的system2()调用，它产生了相同的警告（随后是错误）。