假设您的列表长度相等

正如在评论中指出的，IndexError的发生是由于当你pop()一个项目时，你的列表的长度发生了变化。
由于您在for循环中使用range(len(l))迭代列表，在每次完成循环后都不会更新，因此最终会遇到超出范围的索引。
一个例子，你可以很容易地尝试自己：

l = [1,2,3,4,5,6,7,8,9,10]

for i in range(len(l)):
    l.pop(i)
    print("Length of list", len(l))

不要在for循环中调用print(range(len(l))来混淆自己-这将给予您一个更新的范围，但会产生误导。for循环中的range只被调用一次，因此在迭代时永远不会更新。

不同的方法

不要使用索引，而是尝试使用zip()并构建新列表，而不是更改现有列表。

def change(l1, l2):
    new_l1 = []
    new_l2 = []
    for a, b in zip(l1, l2):
        if len(a) == len(b):
            continue # do nothing
        elif len(a)<len(b):
            new_l2.append(b)
        elif len(a)>len(b):
            new_l1.append(a)
    return new_l1, new_l2

这种方法本质上生成的列表与使用pop()创建的列表相同，同时避免使用索引。
请注意，zip()将在到达两个迭代中较小的一个的末尾时停止。如果列表的长度可能不相等，并且您希望迭代直到完全迭代完两个可迭代项中最长的一个，则使用zip_longest()。但我不认为这是你在这种情况下需要的。

附加说明

如果使用以下代码迭代list，也会遇到问题：

l = [i for i in range(10)]
for item in l:
    l.remove(item)
>>>[1, 3, 5, 7, 9]

本质上，在修改iterable的同时迭代任何iterable是不可取的。这可能会导致从抛出Exception到静默的意外行为。
我知道你是通过循环复制来避免这一点，我只是想为后代添加这个。

您可以向后遍历列表，这样当您从列表中删除一个项目时，尚未检查的元素的索引将不会受到影响

def f(a, b):
    l = len(a) if len(a)<len(b) else len(b)
    for i in range(l):
        j = l-i-1
        la, lb = len(a[j]), len(b[j])
        if la<lb: a.pop(j)
        elif lb<la: b.pop(j)
        else: a.pop(j), b.pop(j)
    return a, b

ps我忠实于你的问题陈述，而不是你的实现，基于字符串长度的比较。

如果你想遍历一个列表并清空它
但不希望弹出索引错误使用此：

lst = [ 1, 4, 56, 2, 4 , 12,  6, 89 ,11, 0]
i =0
while len(lst) != 0:
    lst.pop(0)
    i+=1
print(lst)

如果你指定了IndexError的索引，并且列表小于你的索引，那么弹出抛出IndexError：

>>> [100].pop(1)

Traceback (most recent call last):
  File "<stdin>", line 1, in <module>
IndexError: pop index out of range