我想我可能找到了方法，或者至少找到了一种方法。请告诉我是否有更好的方法来处理这个问题。在catalina.bat文件所在的Tomcat\bin文件夹中，我创建了一个setenv.bat文件，并在其中声明了以下两个Java选项属性：

set JAVA_OPTS="-Djavax.net.ssl.trustStore=C:\path\to\keystore.key" "-Djavax.net.ssl.trustStorePassword=************"

显然，当Tomcat启动时，它会初始化catalina.bat文件，catalina.bat文件会确定setenv.bat文件是否存在，如果存在，则运行该文件以设置Java选项。
再次有人请纠正我，如果我错了，并建议任何更好的方式这样做。虽然很明显，Tomcat是作为Windows服务设置的，但上面的选项是通过tomcatXw.exe输入的，以启动Tomcat控制台，并选择Java选项卡。

如果其他人也有这个问题，这是我做的：
1.导航到\tomcatDirectory\bin
2.根据您的机器编辑catalina.sh/bat。
3.将这些属性添加到JAVA_OPTS属性

JAVA_OPTS="$JAVA_OPTS -Djavax.net.ssl.trustStore=$CATALINA_HOME/certificates/truststore.ks -Djavax.net.ssl.trustStorePassword=truststorePassword -server"

这实际上会告诉tomcat使用指定的信任库，而不是默认的cacc信任库，如果tomcat没有找到系统属性中指定的任何信任库，它将加载默认的信任库。
另外，我注意到可以在tomcat的主配置文件server.xml中定义信任库。您所要做的就是在 connector 属性中设置这些属性。

<Connector port="8443" maxThreads="500"
           server="Apache"
           scheme="https" secure="true" SSLEnabled="true" acceptCount="500"
           keystoreFile="/apps/content/certificates/keystore.ks" keystorePass="keystorepass"
           truststoreFile="/apps/content/certificates/truststore.ks" truststorePass="truststorePassword"/>

试试吧，希望有帮助！

推荐的答案只适用于部署在Windows上的Tomcat，我发现下面的答案在Linux服务器上也适用：
TOMDOGEDIRECTORY/bin/setenv.sh[* 您需要自己创建此文件 *]

JAVA_OPTS="$JAVA_OPTS -Djavax.net.ssl.trustStore=/opt/meh_tuststove.jks" 
JAVA_OPTS="$JAVA_OPTS -Djavax.net.ssl.trustStorePassword=muchsecure" 
export JAVA_OPTS

您需要为此更改server.xml文件。您可以在conf/目录中找到它。
首先取消注解这些行：

<!--
<Connector port="8443" protocol="HTTP/1.1" SSLEnabled="true"
maxThreads="150" scheme="https" secure="true"
clientAuth="false" sslProtocol="TLS" />
-->

然后把它改成这样

<Connector SSLEnabled           ="true"
           acceptCount          ="100"
           clientAuth           ="false"
           disableUploadTimeout ="true"
           enableLookups        ="false"
           maxThreads           ="25"
           port                 ="8443"
           keystoreFile         ="C:\SSLKeys\appkeystore.key"
           keystorePass         ="password"
           protocol             ="org.apache.coyote.http11.Http11NioProtocol"
           scheme               ="https"
           secure               ="true"
           sslProtocol          ="TLS"
/>

对于tomcat9，可以在server.xml中添加信任库，如下所示

<Connector port="<portOnWhichHttpsToBeEnabled>" SSLEnabled="true" protocol="org.apache.coyote.http11.Http11NioProtocol"
               maxThreads="150" scheme="https" secure="true"
               clientAuth="true" sslProtocol="TLS"
               sslEnabledProtocols="TLSv1.2"
               keystoreFile="KEYSTORE_PATH"
               keystorePass="KEYSTORE_PWD"
               truststoreFile="TRUSTSTORE_PATH"
               truststorePass="TRUSTSTORE_PWD"
               URIEncoding="UTF-8"/>

注意：clientAuth必须设置为true
对于tomcat10及以上版本，可以按如下方式添加
第一步：在server.xml中添加密钥库，如下所示

<Connector port="<portOnWhichHttpsToBeEnabled>" SSLEnabled="true" protocol="org.apache.coyote.http11.Http11NioProtocol"
               sslImplementationName="org.apache.tomcat.util.net.openssl.OpenSSLImplementation"
               maxThreads="150" scheme="https" secure="true"
              >
      <SSLHostConfig>
        <Certificate
            certificateKeyAlias="KEYSTORE_ALIAS"
            certificateKeystoreFile=""KEYSTORE_PATH""
            certificateKeystorePassword="KEYSTORE_PWD"
            type="RSA"
        />
      </SSLHostConfig>
    </Connector>

步骤2：然后在setenv.sh中添加信任存储，如下所示

export JAVA_OPTS="$JAVA_OPTS -Djavax.net.ssl.trustStore=TRUSTORE_PATH -Djavax.net.ssl.trustStorePassword=TRUSTSTORE_PWD"

在Tomcat日志中，可以发现信任存储区的加载方式如下

org.apache.tomcat.util.net.AbstractEndpoint.logCertificate Connector [https-openssl-nio-<portOnWhichHttpsToBeEnabled>], TLS virtual host [_default_], certificate type [RSA] configured from keystore [KEYSTORE_PATH] using alias [KEYSTORE_ALIAS] with trust store [TRUSTORE_PATH]