我可以让你的脚本像这样工作：

// bnc/Encryption.java - stub since I do not know your implementation
package bnc;

public class Encryption {

  public static String encrypt(String s) { return s; }
  public static String decrypt(String s) { return s; }
}

#!/usr/bin/env -S scala-cli shebang --server=false
//> using scala 3.3.1
//> using option -explain
//> using jvm zulu-jre:21.0.0
//> using file bnc/Encryption.java

import java.nio.file.Files
import java.nio.file.Path

import bnc.Encryption

val usage = """
  Usage: encryptor ([-e] | [-d]) ([-in filename] | <arg>) > <filename>
"""

def encrypt(string: String): String =
  Encryption.encrypt(string)

def decrypt(string: String): String =
  Encryption.decrypt(string)

def encryptor(args: Array[String]): Unit =
  if (args.isEmpty || args.length != 2 || args.length != 3) {
    println(usage)
    sys.exit(1)
  }

  val e: Boolean = args(0) == "-e"
  val d: Boolean = args(0) == "-d"
  val in: String = if (args(1) == "-in") args(2) else ""
  val str: String = if (args(1) != "-in") args(1) else ""

  if (e && str.length() > 0)
    println(encrypt(str))
  else if (e)
    println(encrypt(Files.readString(Path.of(in))))
  else if (d && str.length > 0)
    println(decrypt(str))
  else if (d)
    println(decrypt(Files.readString(Path.of(in))))
  else {
    println(usage)
    sys.exit(1)
  }

  sys.exit(0)

encryptor(args)

关于你写的：
1.如果您有Scala CLI，则不需要再安装Scala。这是一个所有在一个包：scala + scalac + build工具，几个旧工具的 * 替代品 *。

1. Scala版本可以通过标志和指令来更改

• 如果你正在构建一个“程序”而不是一个“脚本”，你需要使用.scala扩展-程序有入口点，它告诉JVM从哪里开始（@main），而脚本从上到下评估你正在执行的文件中的所有内容（所以它们不需要任何main）。删除@main，并使用args自己调用方法，然后返回到“脚本”模式
• 如果有人感兴趣，为什么@main存在，如果Scala CLI是脚本：它不仅适用于脚本。在一个目录中创建几个.scala文件，在其中一个（最好是project.scala）中放置带有Scala版本，JVM版本，平台，依赖关系等的using指令。然后scala-cli compile .将构建一个普通的项目，如果您使用scala-cli run .，则需要一个入口点。这些Scala文件确实需要.scala扩展名。
• 然而，从上到下评估的单个Scala文件，不打算作为JAR分发，也不打算在IDE中打开，（可选地引用其他.scala或.java文件），可以编写为脚本，其中它们的整个主体是一种主类型。这些文件使用.sc扩展名，尽管对于shebang，您也可以根本不使用扩展名。
• JVM版本可以通过标志和指令来更改。Scala CLI使用coursier，其coursier java --available允许打印所有可以在那里使用的版本。Bloop确保在连续调用之间使用服务器来保持JVM的温度。您可以使用--server=false标志禁用它。
• 6. -您的个人风格偏好是一个非技术问题。另外：您不需要使用-classpath或--classpath-有一个--extra-jars标志用于将JAR（或.class es）添加到运行时，以及//> using jar///> using jars指令用于添加JAR。因为您有一个独立的.class，它不属于xml 2的一部分，但也没有源代码（您可以使用//> using file filename.java添加）的情况相当罕见。

显然，scala-tool的做事方式还没有跟上速度：
1.我不得不在Scala安装中单独安装scala-tool。

1. scala-1.0版本只有3.3.0。我的Scala安装在3.3.1。
   1.我必须在脚本文件名中使用.scala扩展名。
   1.可笑的“bloop”服务器中的JVM使用的是Java 17。我的Java安装使用Java 21。不知道如何修改JVM。为什么我需要一个“bloop”服务器？
   1.我不得不用这个荒谬的东西，而不是一个正常的shebang：#！/usr/bin/env -S scala-pushebang-S 3
   1.看起来你必须使用--classpath而不是--classpath。不，CP，真实的吧.
   嗯，也许Groovy是一个更好的选择。