numpy 冠状方向上的简单ITK切片以颠倒的图像结束？

8mmmxcuj 于 2023-10-19 发布在其他

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SimpleITK版本“2.2.0”。Python版本3.9.3 Numpy版本1.24.2
我使用SimpleITK读取图像，然后在不同的方向上切片。例如，图像是'image. mhd'，我将其读入：

image = sitk.ReadImage('image.mhd')

然后我在冠状面上将其切片：

myslice = image[:, index, :]

然后使用sitk.WriteImage（myslice，'slice. mhd'）将该切片保存回mhd。
当我将它加载回ITK-Snap时，图像是上下颠倒的。为什么呢？我做错什么了吗？
尝试切片SimpleITK加载的图像

1条答案

您的图像可能具有非身份方向。尝试在切片之前使用具有标识（LPS）方向的DICOMOrientImageFilter。