使用math.isclose()来测试数字是否在彼此的公差范围内。
使用any()函数对另一个数组的每个元素进行测试。

flat_A = A.flatten()
flat_B = B.flatten()
result = [a for a in flat_A if any(math.isclose(a, b, abs_tol=1e-9) for b in flat_B)]

如果对B进行排序，可以改进算法。然后你可以使用二进制搜索来找到接近的元素，而不是线性搜索。

使用KDTree % s

from scipy.spatial import KDTree

A_Tree = KDTree(A)
B_Tree = KDTree(B)
a = np.where([len(i) >0 for i in B_Tree.query_ball_tree(A_Tree, 1e-9, p=100)])

a
Out:        v
(array([   10,  3884,  9511, 10878, 23977, 40623, 45204, 49036, 51976,
        54020, 56403, 60273, 64507, 77374, 82695, 91806, 93235, 97881],
       dtype=int64),)

高p范数近似于你正在寻找的切比雪夫距离度量，KDTree在两棵树之间进行二叉树搜索，这比顺序搜索方法快得多，比矢量化方法节省内存得多。

钝器

我认为我们可以检查舍入值的交集来回答数组是否有公共项的问题：

accuracy = 9
intersection = np.isin(A.round(accuracy), B.round(accuracy))
common_items = A[intersection]
has_commons = intersection.any()

• numpy.isin
• Numpy set routines

我同意Barmar的评论，这不是一个准确的工具。我们可以忽略一些小案子。

更精准的工具

这将需要更多的时间，当使用numba时，我似乎可以接受，除非有其他要求（在i3-2100 3GHz上，需要4分钟才能得到答案）：

import numpy as np
from numba import njit

@njit
def intersect(a, b):
    '''return an array c of a.shape with c[i]=1 if a[i] is close to any item in b'''
    a_shape = a.shape
    a = a.ravel()
    c = np.zeros_like(a)
    for i in range(c.size):
        c[i] = np.isclose(b, a[i]).any()
    return c.reshape(a_shape)

• p.s.问题仍然是开放的：比较什么-矩阵单元格还是它们的行？*

您可以对数组进行排序以降低复杂性。

示例

import numpy as np
import numba as nb

@nb.njit() #With jit approx. 30ms, without approx. 500ms
def get_simmilar(A,B):
    """
    Returns a set with the indices to A_sorted
    """
    idx_A=np.argsort(A[:,0])
    A_sorted = A[idx_A,:] 

    idx_B=np.argsort(B[:,0])
    B_sorted = B[idx_B,:]

    a=set()
    ii=0
    for i in range(A_sorted.shape[0]):
        while A_sorted[i,0] > B_sorted[ii,0] and not ii > B_sorted.shape[0]-1:
            ii+=1
        if np.max(np.abs(A_sorted[i,:] - B_sorted[ii-1,:])) < 1e-9:
            a.add(i)
        if np.max(np.abs(A_sorted[i,:] - B_sorted[ii,:])) < 1e-9:
             a.add(i)
    return a,A_sorted

a,A_sorted =  get_simmilar(A, B)
A_sorted[list(a),:]