我已经找到了一种方法来做到这一点（使用Fundamental theorem of software engineering）。事情没我想的那么简单，但就是这样.
首先，创建一个文件**${CMAKE_SOURCE_REQ}/cmake/RunTests.cmake**，其中包含

if(NOT DEFINED ENV{TESTS_ARGUMENTS})
    set(ENV{TESTS_ARGUMENTS} "--default-arguments")
endif()
execute_process(COMMAND ${TEST_EXECUTABLE} $ENV{TESTS_ARGUMENTS} RESULT_VARIABLE result)
if(NOT "${result}" STREQUAL "0")
    message(FATAL_ERROR "Test failed with return value '${result}'")
endif()

然后，在添加测试时，使用

add_test(
    NAME MyTest
    COMMAND ${CMAKE_COMMAND} -DTEST_EXECUTABLE=$<TARGET_FILE:MyTest> -P ${CMAKE_SOURCE_DIR}/cmake/RunTests.cmake
)

最后，您可以使用

cmake -E env TESTS_ARGUMENTS="--custom-arguments" ctest

注意，如果使用bash，可以将其简化为

TESTS_ARGUMENTS="--custom-arguments" ctest

这种方法存在一些问题，例如：它忽略测试的WILL_FAIL属性。当然，我希望它可以像调用ctest -- --custom-arguments一样简单，但是，正如Stones所说，You can't always get what you want。

我不确定我是否完全理解您想要的，但我仍然可以给予一种方法，在运行时将参数传递给CTest中的测试。
我将给你一个给予CTK（通用工具包，https://github.com/commontk/CTK）的例子：
在构建目录中（例如：CTK-build/CTK-build，它是一个超级构建），如果我运行：（“-V”表示详细，“-N”仅表示视图模式）

ctest -R ctkVTKDataSetArrayComboBoxTest1 -V -N

我得到：

UpdateCTestConfiguration  from : /CTK-build/CTK-build/DartConfiguration.tcl
Parse Config file:/CTK-build/CTK-build/DartConfiguration.tcl
 Add coverage exclude regular expressions.
 Add coverage exclude: /CMakeFiles/CMakeTmp/
 Add coverage exclude: .*/moc_.*
 Add coverage exclude: .*/ui_.*
 Add coverage exclude: .*/Testing/.*
 Add coverage exclude: .*/CMakeExternals/.*
 Add coverage exclude: ./ctkPixmapIconEngine.*
 Add coverage exclude: ./ctkIconEngine.*
UpdateCTestConfiguration  from :/CTK-build/CTK-build/DartConfiguration.tcl
Parse Config file:/CTK-build/CTK-build/DartConfiguration.tcl
Test project /CTK-build/CTK-build
Constructing a list of tests
Done constructing a list of tests

178: Test command: /CTK-build/CTK-build/bin/CTKVisualizationVTKWidgetsCppTests "ctkVTKDataSetArrayComboBoxTest1"
Labels: CTKVisualizationVTKWidgets
  Test #178: ctkVTKDataSetArrayComboBoxTest1

Total Tests: 1

您可以在终端中复制粘贴“测试命令”：

/CTK-build/CTK-build/bin/CTKVisualizationVTKWidgetsCppTests "ctkVTKDataSetArrayComboBoxTest1"

并添加参数，例如“-I”用于交互式测试：

/CTK-build/CTK-build/bin/CTKVisualizationVTKWidgetsCppTests "ctkVTKDataSetArrayComboBoxTest1" "-I"

告诉我是否有用。

马修的回答给了我一个线索让它为我工作。
对于我的代码，我做了以下事情：
输入命令ctest -V -R TestMembraneCellCrypt -N以获得输出：

...
488: Test command: path/to/ctest/executable/TestMembraneCellCrypt
Labels: Continuous_project_ChasteMembrane
  Test #488: TestMembraneCellCrypt
...

然后我复制了Test command并在那里提供了参数：

path/to/ctest/executable/TestMembraneCellCrypt -e 2 -em 5 -ct 10

我会注意到，我使用的包（Chaste），是相当大的，所以可能有一些事情，我不知道。

我也遇到了类似的问题，在测试中进行了大量的测试运行。如果设置了环境变量，则使用值，否则使用常量默认值。
诀窍是使用shell运行测试可执行文件并使用参数扩展。
与

a=${VAR:-20}

如果设置了VAR，shell将为“a”分配VAR的值，否则将为其分配默认值20 --这也可以是表达式的结果。
使用CMake代码的Sniper如下：

find_program(SHELL sh)

string(JOIN " " LIBFUZZER_OPTS
    -mutate_depth=20
    -runs=$\{RUNS:-${DEFAULT_RUNS_NUMBER}\}
    -artifact_prefix=${test_name}_
)
add_test(NAME ${test_name}
         COMMAND ${SHELL} -c "$<TARGET_FILE:${test_name}> ${LIBFUZZER_OPTS}"
)

使用CTest运行测试：

$ RUNS=10 ctest -R luaL_gsub_test --verbose
<snipped>
1: Done 10 runs in 0 second(s)

默认情况下，使用相同的运行次数：

$ ctest -R luaL_gsub_test --verbose
<snipped>
1: Done 5 runs in 0 second(s)

请参阅commit，它向CTest添加了一些测试运行。
值得一提的是，CMake中有一个issue，人们请求转发命令行参数来测试可执行文件。