matplotlib 如何使用imshow将NaN值绘制为特殊颜色?

zed5wv10  于 2023-10-24  发布在  其他
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我尝试在matplotlib中使用imshow将数据绘制为热图,但有些值是NaN。我希望NaN被渲染为在色彩图中找不到的特殊颜色。
举例说明:

import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
f = plt.figure()
ax = f.add_subplot(111)
a = np.arange(25).reshape((5,5)).astype(float)
a[3,:] = np.nan
ax.imshow(a, interpolation='nearest')
f.canvas.draw()

生成的图像出乎意料地全是蓝色(jet颜色图中最低的颜色)。然而,如果我这样绘制:

ax.imshow(a, interpolation='nearest', vmin=0, vmax=24)

--然后我得到了更好的东西,但是NaN值被绘制成与vmin相同的颜色.有没有一种优雅的方法可以让我将NaN设置为使用特殊颜色(例如:灰色或透明)绘制?

z8dt9xmd

z8dt9xmd1#

Hrm,看起来我可以使用一个掩码数组来做到这一点:

masked_array = np.ma.array (a, mask=np.isnan(a))
cmap = matplotlib.cm.jet
cmap.set_bad('white',1.)
ax.imshow(masked_array, interpolation='nearest', cmap=cmap)

这应该足够了,虽然我仍然开放的建议。:)

z0qdvdin

z0qdvdin2#

在Matplotlib的新版本中,不再需要使用掩码数组。
例如,让我们生成一个数组,其中每个第7个值都是NaN:

arr = np.arange(100, dtype=float).reshape(10, 10)
arr[~(arr % 7).astype(bool)] = np.nan

matplotlib v3.7.0中,.cm.get_cmap().colormaps.get_cmap('viridis')替换
.set_bad设置颜色。

import matplotlib as mpl
import matplotlib.pyplot as plt
import numpy as np

arr = np.arange(100, dtype=float).reshape(10, 10)
arr[~(arr % 7).astype(bool)] = np.nan

cmap = mpl.colormaps.get_cmap('viridis')  # viridis is the default colormap for imshow
cmap.set_bad(color='red')

plt.imshow(arr, cmap=cmap)

.cm.get_cmap()已弃用

我们可以修改当前的颜色Map表,并使用以下行绘制数组:

current_cmap = mpl.cm.get_cmap()
current_cmap.set_bad(color='red')
plt.imshow(arr)

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