对于你已经暗示和显示的任务，我不确定你是否需要使用双引号作为一个过滤器。我这么说的原因是你假设双引号总是存在于字符串中，如果文件不存在于使用问题字符的位置，情况可能就不是这样了。
因此，我建议您使用两个已知的过滤器，即文件扩展名。
批处理文件示例，（假设源数据是sc.exe的qc选项的结果，* 根据需要更改ServiceName *）：

@For /F "Tokens=1,2,*" %%G In ('%SystemRoot%\System32\sc.exe qc ServiceName
 2^>NUL') Do @If "%%G" == "BINARY_PATH_NAME" For %%J In (%%I
) Do @If /I "%%~xJ" == ".exe" (Echo Application path is: %%~J
) Else If /I "%%~xJ" == ".conf" Echo Configuration file path is: %%~J

字符串
或者直接在cmd.exe中：

For /F "Tokens=1,2,*" %G In ('%SystemRoot%\System32\sc.exe qc ServiceName 2^>NUL') Do @If "%G" == "BINARY_PATH_NAME" For %J In (%I) Do @If /I "%~xJ" == ".exe" (Echo Application path is: %~J) Else If /I "%~xJ" == ".conf" Echo Configuration file path is: %~J

型

鉴于你的样本数据不足

@ECHO OFF
SETLOCAL

SET "variable=BINARY_PATH_NAME   : "C:\Program Files\Application\Application.exe" -c "C:\Program Files\Application\Application.conf" -f=false"
SET "var1="
FOR %%e IN (%variable%) DO IF "%%e" neq "%%~e" IF DEFINED var1 (SET "var2=%%e") ELSE (SET "var1=%%e")
SET var

GOTO :EOF

字符串
简单地将variable作为列表处理，并通过比较%%e和%%~e来检测元素中的引号。