小文件是指文件size小于HDFS上block大小的文件。这样的文件会给hadoop的扩展性和性能带来严重问题。首先,在HDFS中,任何block,文件或者目录在内存中均以对象的形式存储,每个对象约占150byte,如果有1千万个小文件,每个文件占用一个block,则NameNode大约需要2G空间。如果存储一亿个文件,则NameNode需要20G空间。这样NameNode内存容量严重制约了集群的扩展。其次,访问大量小文件速度远远小于访问几个大文件。HDFS最初是为流式访问大文件开发的,如果访问大量小文件,需要不断的从一个DataNode跳到另外一个DataNode,严重影响性能。最后,处理大量小文件速度远远小于处理同等大小的大文件的速度。每一个小文件要占用一个slot,而task启动将耗费大量时间甚至大部分时间都耗费在启动task和释放task上。
A.client端发送读文件请求给NameNode,如果文件不存在,返回错误信息,否则,将该文件对应的block机器所在DataNode位置发送给client。
B.client收到文件位置信息后,与不同DataNode建立socket连接并行获取数据。
A.client端发送写文件请求,NameNode检查文件是否存在,如果已经存在,直接返回错误信息,否则,发送给client一些可用节点。
B.client将文件分块,并行存储到不同DataNode节点上,发送完成以后,client同时发送信息给NameNode和DataNode。
C.NameNode收到client的信息后,发送信息给DataNode。
D.DataNode同时收到NameNode和DataNode的确认信息后,提交写操作。
public class AppForSmallFile {
//定义文件读取的路径
private static final String OUTPATH = "hdfs://liaozhongmin:9000";
public static void main(String[] args) {
//定义FSDataOutputStream对象
FSDataOutputStream fsDataoutputStream = null;
//定义输入流读文件
InputStreamReader inputStreamReader = null;
try {
//创建合并后文件存储的的路径
Path path = new Path(OUTPATH + "/combinedFile");
//创建FSDataOutputStream对象
fsDataoutputStream = FileSystem.get(path.toUri(), new Configuration()).create(path);
//创建要合并的小文件路径
File sourceDir = new File("C:\\Windows\\System32\\drivers\\etc");
//遍历小文件
for (File fileName : sourceDir.listFiles()){
//创建输入流
//fileInputStream = new FileInputStream(fileName.getAbsolutePath());
//只有这样才可以制定字符编码(没办法,Window是默认GBK的,Hadoop是默认UTF-8的,所以读的时候就会乱码)
inputStreamReader = new InputStreamReader(new FileInputStream(fileName), "gbk");
//一行一行的读取
List<String> readLines = IOUtils.readLines(inputStreamReader);
//然后再写出去
for (String line : readLines){
//写入一行
fsDataoutputStream.write(line.getBytes());
//写入一个换行符
fsDataoutputStream.write("\n".getBytes());
}
}
System.out.println("合并成功");
} catch (Exception e) {
e.printStackTrace();
} finally{
try {
inputStreamReader.close();
fsDataoutputStream.close();
} catch (IOException e) {
e.printStackTrace();
}
}
}
}
注:这种方案是使用java文件相关操作,将众多的小文件写到一个文件中。
创建文件 hadoop archive -archiveName xxx.har -p /src /dest
查看内部结构 hadoop fs -lsr /dest/xxx.har
查看内容 hadoop fs -lsr har:///dest/xxx.har
提供两种将小文件打成SequenceFile的方法:
方法一:
public class WriteSequenceMapReduce {
// 定义输入路径
private static final String INPUT_PATH = "hdfs://master:9000/files";
// 定义输出路径
private static final String OUT_PATH = "hdfs://master:9000/seq/";
//定义文件系统
private static FileSystem fileSystem = null;
public static void main(String[] args) {
try {
// 创建配置信息
Configuration conf = new Configuration();
// 创建文件系统
fileSystem = FileSystem.get(new URI(OUT_PATH), conf);
// 如果输出目录存在,我们就删除
if (fileSystem.exists(new Path(OUT_PATH))) {
fileSystem.delete(new Path(OUT_PATH), true);
}
// 创建任务
Job job = new Job(conf, WriteSequenceMapReduce.class.getName());
// 1.1 设置输入目录和设置输入数据格式化的类
FileInputFormat.setInputPaths(job, INPUT_PATH);
// 1.2 设置自定义Mapper类和设置map函数输出数据的key和value的类型
job.setMapperClass(WriteSequenceMapper.class);
// 2.3 指定输出的路径和设置输出的格式化类
FileOutputFormat.setOutputPath(job, new Path(OUT_PATH));
// 提交作业 退出
System.exit(job.waitForCompletion(true) ? 0 : 1);
} catch (Exception e) {
e.printStackTrace();
}
}
public static class WriteSequenceMapper extends Mapper<LongWritable, Text, Text, BytesWritable> {
// 定义SequenceFile.Reader对象用于读文件
private static SequenceFile.Writer writer = null;
// 定义配置信息
private static Configuration conf = null;
// 定义最终输出的key和value
private Text outkey = new Text();
private BytesWritable outValue = new BytesWritable();
//定义要合并的文件(存放在数组中)
private FileStatus[] files = null;
//定义输入流和一个字节数组
private InputStream inputStream = null;
private byte[] buffer = null;
@Override
protected void setup(Mapper<LongWritable, Text, Text, BytesWritable>.Context context) throws IOException, InterruptedException {
try {
// 创建配置信息
conf = new Configuration();
// 创建Path对象
Path path = new Path(INPUT_PATH);
// 创建SequenceFile.Writer对象,并指定压缩格式
writer = SequenceFile.createWriter(fileSystem,conf, new Path(OUT_PATH+"/total.seq"), Text.class, BytesWritable.class, CompressionType.BLOCK, new BZip2Codec());
//writer = SequenceFile.createWriter(fileSystem,conf, new Path(OUT_PATH+"/total.seq"), Text.class, BytesWritable.class);
//获取要合并的文件数组
files = fileSystem.listStatus(path);
} catch (Exception e) {
e.printStackTrace();
}
}
@Override
protected void map(LongWritable key, Text value, Mapper<LongWritable, Text, Text, BytesWritable>.Context context) throws IOException, InterruptedException {
//遍历文件数组
for (int i=0; i<files.length; i++){
//将文件名作为输出的key
outkey.set(files[i].getPath().toString());
//创建输入流
inputStream = fileSystem.open(files[i].getPath());
//创建字节数组
buffer = new byte[(int) files[i].getLen()];
//通过工具类将文件读到字节数组中
IOUtils.readFully(inputStream, buffer, 0, buffer.length);
//将字节数组中的内容及单个文件的内容作为value输出
outValue.set(new BytesWritable(buffer));
//关闭输入流
IOUtils.closeStream(inputStream);
//将结果写到Sequencefile中
writer.append(outkey, outValue);
}
//关闭流
IOUtils.closeStream(writer);
//System.exit(0);
}
}
}
方法二:自定义InputFormat和RecordReader实现
public class WholeFileInputFormat extends FileInputFormat<NullWritable, BytesWritable>{
@Override
public RecordReader<NullWritable, BytesWritable> createRecordReader(InputSplit split, TaskAttemptContext context) throws IOException, InterruptedException {
//创建自定义的RecordReader
WholeFileRecordReader reader = new WholeFileRecordReader();
reader.initialize(split, context);
return reader;
}
@Override
protected boolean isSplitable(JobContext context, Path filename) {
return false;
}
}
public class WholeFileRecordReader extends RecordReader<NullWritable, BytesWritable>{
private FileSplit fileSplit;
private Configuration conf;
private BytesWritable value = new BytesWritable();
private boolean processed = false;
public void initialize(InputSplit split, TaskAttemptContext context) throws IOException, InterruptedException{
this.fileSplit = (FileSplit) split;
this.conf = context.getConfiguration();
}
/**
* process表示记录是否已经被处理过了
*/
@Override
public boolean nextKeyValue() throws IOException, InterruptedException {
if (!processed){
byte[] contents = new byte[(int) fileSplit.getLength()];
//获取路径
Path file = fileSplit.getPath();
//创建文件系统
FileSystem fileSystem = file.getFileSystem(conf);
FSDataInputStream in = null;
try {
//打开文件
in = fileSystem.open(file);
//将file文件中的内容放入contents数组中。使用了IOUtils工具类的readFully()方法,将in流中的内容读到contents字节数组中
IOUtils.readFully(in, contents, 0, contents.length);
//BytesWritable是一个可用做key或value的字节序列,而ByteWritable是单个字节
//将value的内容设置为contents的值
value.set(contents, 0, contents.length);
} catch (Exception e) {
e.printStackTrace();
} finally{
IOUtils.closeStream(in);
}
processed = true;
return true;
}
return false;
}
@Override
public NullWritable getCurrentKey() throws IOException, InterruptedException {
return NullWritable.get();
}
@Override
public BytesWritable getCurrentValue() throws IOException, InterruptedException {
return value;
}
@Override
public float getProgress() throws IOException, InterruptedException {
return processed ? 1.0f : 0.0f;
}
@Override
public void close() throws IOException {
//do nothing
}
}
public class SmallFilesToSequenceFileConverter {
// 定义输入路径
private static final String INPUT_PATH = "hdfs://master:9000/files/*";
// 定义输出路径
private static final String OUT_PATH = "hdfs://<span style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">master</span>:9000/seq/total.seq";
public static void main(String[] args) {
try {
// 创建配置信息
Configuration conf = new Configuration();
// 创建文件系统
FileSystem fileSystem = FileSystem.get(new URI(OUT_PATH), conf);
// 如果输出目录存在,我们就删除
if (fileSystem.exists(new Path(OUT_PATH))) {
fileSystem.delete(new Path(OUT_PATH), true);
}
// 创建任务
Job job = new Job(conf, SmallFilesToSequenceFileConverter.class.getName());
//1.1 设置输入目录和设置输入数据格式化的类
FileInputFormat.addInputPaths(job, INPUT_PATH);
job.setInputFormatClass(WholeFileInputFormat.class);
//1.2 设置自定义Mapper类和设置map函数输出数据的key和value的类型
job.setMapperClass(SequenceFileMapper.class);
job.setMapOutputKeyClass(Text.class);
job.setMapOutputValueClass(BytesWritable.class);
//1.3 设置分区和reduce数量(reduce的数量,和分区的数量对应,因为分区为一个,所以reduce的数量也是一个)
job.setPartitionerClass(HashPartitioner.class);
//千万不要有这句话,否则单个小文件的内容会输出到单独的一个Sequencefile文件中(简直内伤)
//job.setNumReduceTasks(0);
FileOutputFormat.setOutputPath(job, new Path(OUT_PATH));
job.setOutputFormatClass(SequenceFileOutputFormat.class);
// 此处的设置是最终输出的key/value,一定要注意!
job.setOutputKeyClass(Text.class);
job.setOutputValueClass(BytesWritable.class);
// 提交作业 退出
System.exit(job.waitForCompletion(true) ? 0 : 1);
} catch (Exception e) {
e.printStackTrace();
}
}
public static class SequenceFileMapper extends Mapper<NullWritable, BytesWritable, Text, BytesWritable> {
// 定义文件的名称作为key
private Text fileNameKey = null;
/**
* task调用之前,初始化fileNameKey
*/
@Override
protected void setup(Mapper<NullWritable, BytesWritable, Text, BytesWritable>.Context context) throws IOException, InterruptedException {
// 获取分片
InputSplit split = context.getInputSplit();
// 获取输入目录
Path path = ((FileSplit) split).getPath();
// 设置fileNameKey
fileNameKey = new Text(path.toString());
}
@Override
protected void map(NullWritable key, BytesWritable value, Mapper<NullWritable, BytesWritable, Text, BytesWritable>.Context context) throws IOException,
InterruptedException {
// 将fileNameKey作为输出的key(文件名),value作为输出的value(单个小文件的内容)
System.out.println(fileNameKey.toString());
context.write(fileNameKey, value);
}
}
}
注:方法二的这三个类可以实现将小文件写到一个SequenceFile中。
读取SequenceFile文件:
public class ReadSequenceMapReduce {
// 定义输入路径
private static final String INPUT_PATH = "hdfs://master:9000/seq/total.seq";
// 定义输出路径
private static final String OUT_PATH = "hdfs://<span style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">master</span>:9000/seq/out";
//定义文件系统
private static FileSystem fileSystem = null;
public static void main(String[] args) {
try {
// 创建配置信息
Configuration conf = new Configuration();
// 创建文件系统
fileSystem = FileSystem.get(new URI(OUT_PATH), conf);
// 如果输出目录存在,我们就删除
if (fileSystem.exists(new Path(OUT_PATH))) {
fileSystem.delete(new Path(OUT_PATH), true);
}
// 创建任务
Job job = new Job(conf, ReadSequenceMapReduce.class.getName());
// 1.1 设置输入目录和设置输入数据格式化的类
FileInputFormat.setInputPaths(job, INPUT_PATH);
// 这个很重要,指定使用SequenceFileInputFormat类来处理我们的输入文件
job.setInputFormatClass(SequenceFileInputFormat.class);
// 1.2 设置自定义Mapper类和设置map函数输出数据的key和value的类型
job.setMapperClass(ReadSequenceMapper.class);
job.setMapOutputKeyClass(Text.class);
job.setMapOutputValueClass(Text.class);
// 1.3 设置分区和reduce数量
job.setPartitionerClass(HashPartitioner.class);
job.setNumReduceTasks(0);
// 最终输出的类型
job.setOutputKeyClass(Text.class);
job.setOutputValueClass(Text.class);
// 2.3 指定输出的路径和设置输出的格式化类
FileOutputFormat.setOutputPath(job, new Path(OUT_PATH));
job.setOutputFormatClass(TextOutputFormat.class);
// 提交作业 退出
System.exit(job.waitForCompletion(true) ? 0 : 1);
} catch (Exception e) {
e.printStackTrace();
}
}
public static class ReadSequenceMapper extends Mapper<Text, BytesWritable, Text, Text> {
//定义SequenceFile.Reader对象用于读文件
private static SequenceFile.Reader reader = null;
//定义配置信息
private static Configuration conf = null;
//定义最终输出的value
private Text outValue = new Text();
/**
* 在setUp()函数中初始化相关对象
*/
@Override
protected void setup(Mapper<Text, BytesWritable, Text, Text>.Context context) throws IOException, InterruptedException {
try {
// 创建配置信息
conf = new Configuration();
// 创建文件系统
//FileSystem fs = FileSystem.get(new URI(INPUT_PATH), conf);
// 创建Path对象
Path path = new Path(INPUT_PATH);
// 创建SequenceFile.Reader对象
reader = new SequenceFile.Reader(fileSystem, path, conf);
} catch (Exception e) {
e.printStackTrace();
}
}
@Override
protected void map(Text key, BytesWritable value, Mapper<Text, BytesWritable, Text, Text>.Context context) throws IOException, InterruptedException {
if (!"".equals(key.toString()) && !"".equals(value.get())){
//设置输出的value
outValue.set(new String(value.getBytes(), 0, value.getLength()));
//把结果写出去
context.write(key, outValue);
}
}
}
}
具体查看:MapReduce基于CombineFileInputFormat处理海量小文件
原文转自:https://blog.csdn.net/lzm1340458776/article/details/43410731
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原文链接 : https://marco.blog.csdn.net/article/details/81626353
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